称「接李宗羲咨函内称：日本国兵船于三月下旬，有驶进厦门海口者；有前往台湾者，由琅■〈穴上弘下〉地方登岸，并无阻问之人。英国水师提督，亦选兵船往台湾迤南巡查。并闻日本购买轮船，装截军装、粮饷；法国及日本兵船，均已抵厦。日本兵共八营，俱在台湾东海旁起岸，欲攻生番。本月初间，始准李鹤年函称：「台湾道禀报，二月间日本水师官同伙一人抵琅■〈穴上弘下〉柴城一带，查看牡丹社等处形势绘图；并声称牡丹社系属番界，彼自寻衅，在我势难禁止」等语。生番地方久隶中国版图，与台湾唇齿相依，日本相距尤近，且各国均有兵船驶往；台湾道视为番界寻衅，势难禁止，实属不知缓急！见在日本兵船已赴台湾，且有登岸情事；亟应迅筹办法。沈葆桢着授为钦差办理台湾等处海防兼理各国事务大臣，以重事权。所有福建镇、道等官均归节制，江苏、广东沿海各口轮船准其调遣，俾得与日本及各国按约辩论；而于征调兵弁、船只等事，亦臻便捷。该大臣接奉前旨，计已驰赴台湾一带。着即体察情形，或谕以情理、或示以兵威，悉心酌度，妥速办理；并与潘霨随时慎密筹办。一面会商文煜、李鹤年等督饬镇、道妥为布置，期于消患方萌，不得稍涉大意；一面将见在办法及台湾如何情形？迅速奏闻，以慰廑系。除江苏、广东沿海各口轮船用款仍由各该省拨给外，所有该大臣需用饷银，着文煜、李鹤年筹款源源接济，毋任缺乏。应调官兵，并着李鹤年迅速拨派，毋误事机』。
戊子（十六日），谕军机大臣等：『李鹤年奏「日本师船拟攻台湾番境，相机妥筹」一折，据称「日本以土番劫杀该国遭风难民，率领兵船拟攻台湾番境；见已照覆该国将官令其早日回兵，并饬台湾镇、道按约理论」等语。日本违约兴兵，前据总理各国事务衙门具奏，已派沈葆桢、潘霨前往台湾生番一带察看，与文煜、李鹤年等会商办理，嗣后复授沈葆桢为钦差办理台湾等处海防兼理各国事务大臣。见在日本兵船已有登岸情事，各国船只复驶往福建洋面，较李鹤年所奏情形尤为吃紧；着沈葆桢懔遵前日谕旨，与潘霨慎密筹划，随时会商文煜、李鹤年等悉心布置，毋令侵越，方为妥善。并着文煜、李鹤年将拨饷、拨兵事宜，遵旨妥速筹办，毋误事机。日本是否回兵？台湾镇、道如何与之理论？即着据实奏闻』。
癸巳（二十一日），谕军机大臣等：『李鹤年奏「日本兵船已抵台湾番境，密筹防范」并「详陈台湾地利」各折片，日本兵船不候照覆，即行驶赴台湾登岸扎营；李鹤年已派水陆各营分往凤山、澎湖等处屯扎，并调集庄团、水师防范台境，藉壮声威，以期有备无患。番地虽居荒服，究隶中国版图；其戕杀日本难民，当听中国持平办理，日本何得遽尔兴兵、侵轶入境。若谓该国仅与生番寻仇、未扰腹地，遂听其蛮触相争，必为外国所轻视，更生觊觎。衅端固不可开，体制更不可失；该督惟当按约理论，阻令回兵，以敦和好。不得以番地异于腹地，遂听其肆意妄为也。派往琅■〈穴上弘下〉之员与日本如何辩论？能否就我范围？着该督据实奏闻；仍随时会同文煜悉心布置，务臻周密。沈葆桢计当起程，着懔遵迭次谕旨，与潘霨慎密筹划，会商文煜、李鹤年妥为办理，毋稍大意。近日台湾番境情形若何？着随时详细具奏。另片奏称查办彰化匪徒各情，匪党虽就殄除，恐有余孽潜藏，根株未尽；匪首廖有富亦未就捦。着李鹤年檄令台湾镇、道饬属一体查拏，务将廖有富等按名弋获，尽法惩治；毋令死灰复然』。
丁酉（二十五日），谕军机大臣等：『李鹤年奏「日本师船已与生番接仗，见筹防范」一折，日本并不遵约回兵，已与生番接仗，即日移营进剿。该国见到轮船七只，尚有铁甲船及坚固兵船未到；此时衅端已开，自应先事布置，严密设防，以期有备无患。江苏、广东沿海各口轮船，前已有旨准归沈葆桢调遣，李鹤年亦拟添调直隶、江苏轮船赴闽防范；应需轮船若干只？即着李鸿章、李宗羲、张树声、瑞麟、张兆栋如数发往，以壮声势。日本被伤者是否止系数人？至生番有无被伤之人？未据该督奏及。生番既居中国土地，即当一视同仁，不得谓化外游民，恝置不顾，任其惨遭荼毒；事关海疆安危大计，未可稍涉疏虞，致生后患。着沈葆桢懔遵迭次谕旨，随时与潘霨筹划，会商文煜、李鹤年办理；总当消弭边衅、豫遏诡谋，方为不负委任。李鹤年所筹自强之策有无把握？是否办有端倪？不得以空言塞责，致误事机』。
饬广东等省迅解闽省兵饷。
五月壬寅朔，谕军机大臣等：『文煜、李鹤年、沈葆桢奏「遵旨会筹台湾防务大概情形」一折，览奏均属妥协。日本上年遭风难民，经台湾商民与熟番救出交回；该国转藉他国积年旧案，越境称兵。沈葆桢等拟将迭次洋船遭风各案摘要照会各国领事，其不候照覆即举兵入境与生番开仗各情形亦分次照会，令其公评曲直；并拟购买铁甲船、水雷及各项军火器械，均着照所议行。并准其将闽省存款移缓就急，酌量动用；如有不敷，即照所请暂借洋款，以应急需。调赴浙江之「伏波」轮船，着沈葆桢迅速调回；直隶、江苏、广东沿海