轮船应如何调拨之处？着沈葆桢等与李鸿章、李宗羲、张树声、瑞麟、张兆栋咨商妥办。前署台湾道黎兆棠，据沈葆桢奏称该员洞悉详情；着瑞麟、张兆栋饬令即行起程赴闽，以资得力。所请设电线以通消息，亦着沈葆桢等迅速办理。该大臣此时计已起程前赴台湾，着即察看情形，妥速筹办；一面详悉具奏，用慰廑系。罗大春、潘霨等到台后，沈葆桢即与该员等随时会商办理。该省防务，沈葆桢、文煜、李鹤年当统筹全局，妥为布置。另片奏「请派员稽察船政」等语，沈葆桢见在赴台，着文煜等传谕前陕西布政使林寿图前往船厂认真稽查，随时察看海口情形；如有紧要事宜，与文煜、李鹤年妥为备御，并着会衔具奏』。
壬子（十一日），谕军机大臣等：『沈葆桢等奏「据报台湾近日情形」一折，日本已分三路进攻番社，生番逃散，遂将牡丹社等焚烧，并欲攻龟仔丹社；乘隙寻仇，意图深入。若再不亟筹办法，则生番更遭荼毒。沈葆桢已与潘霨起程赴台，邀集各国领事公评曲直；若能敛兵回国，自可消弭衅端。倘仍悍然不顾，不得迁就因循，转误事机。沈葆桢与潘霨相度机宜，悉心筹办。应如何调拨官兵前往，藉壮声势之处？着会商文煜、李鹤年妥速布置，以维大局。本日有旨谕令王凯泰即行起程回任，毋庸来京陛见；该抚回任后，着李鹤年随时和衷商办，以期共济时艰』。
谕：『李鹤年奏「闽省海防紧要，请饬抚臣迅回本任」一折，福建巡抚王凯泰前经行抵苏州，因病奏请开缺，当经降旨赏假两个月，毋庸开缺；见在闽省自日本违约兴师、占踞台湾牡丹社一带，该省海防关系紧要，着李宗羲、张树声即行传知该抚速行回任，以重地方。王凯泰于接奉此旨后，即日起程赴闽，毋庸来京陛见；不得俟假期届满，致有迟误。将此由五百里各谕令知之』。
丙寅（二十五日），谕军机大臣等：『沈葆桢等奏「到台日期，筹办大概情形」并「番目吁乞归化，台、澎防兵拟另招精壮充补，请将台湾课税等银拨充经费」各折片，沈葆桢、潘霨先后行抵台湾察看该处情形，沈葆桢结与日本西乡从道照会词意颇为严正，潘霨于本月初八日亲赴琅■〈穴上弘下〉面加诘问，设防之事自属万不容缓。沈葆桢等拟于海口建筑炮台、安放巨炮，使不得停泊兵船；北路淡水等处派兵驻扎，由提督罗大春督率巡防，并另招劲勇、多备军火等事：所筹均是，即着该大臣等妥速办理。日本借口他国积年旧案违约称兵，曲直是非，中共外见。沈葆桢务当与之极力理论，不得稍涉迁就，致误事机。该国如何照覆？潘霨到琅■〈穴上弘下〉后如何辩论情形，着随时详悉奏闻，以慰廑系。生番本隶中国版图，朝廷一视同仁；迭谕该大臣等设法抚绥，不得视同化外，任其惨罹荼毒。见据各社番目吁乞归化，即着该大臣等酌度机宜，妥为收抚，联络声势，以固其心。台、澎向用内地班兵，率皆疲弱；见在因时制宜，自不妨变通办理。沈葆桢等拟将班兵疲弱者撤令归伍，另招本地精壮充补，事平之后察看情形再行酌办；即着照所议行。台湾盐课、关税、厘金等款，准其尽数截留，拨充海防经费，归台湾道衙门支销；不敷之款，着文煜、李鹤年筹拨接济，毋令缺乏』。
戊辰（二十七日），谕军机大臣等：『文煜、李鹤年奏「筹办沿海各口防务」一折，马祖澳及白犬洋面已有日本铁甲船、木轮舟在彼游弋，并有「孟春」兵船自厦门测水直至中岐，意存恫喝；此时防务，自应严密布置，以备不虞。览文煜、李鹤年所奏筹防情形，半属空言，并无切实办法；当此事机紧要之际，若再掉以轻心，必致临事张皇，贻误大局。究竟福、厦各口何处最为扼要？见应如何设防？福宁、连江沿海一带作何准备？是否已臻周密？着文煜、李鹤年悉心筹划，立见施行；不得以含混一奏，遂为了事。沈葆桢见于淡水等处派兵驻扎，由罗大春督率巡防，责任綦重；仍当遵奉前旨，檄令即日赴台，以资得力。着文煜、李鹤年另派得力之员统兵驻扎厦门，并会商李新燕妥为筹布。近省情形，当随时知照沈葆桢、潘霨，以期声息互通』。
谕：『见在日本与台湾生番称兵构衅，迭经据理晓谕，仍未遵约退兵；近复有兵船在福州口往来。本日据文煜、李鹤年奏请留提督罗大春暂缓赴台，驻扎厦门一带以资镇守。但台湾事机甚急，昨经沈葆桢奏业与潘霨先后抵台，拟于该处海口建筑炮台，并派兵驻扎淡水等处，由罗大春督率巡防；是该提督亟应速赴台湾。省防一时未能兼顾，而福州各处海口关系紧要，防守需人；福建水师提督彭楚汉，前经李鸿章奏请留带直隶练军，暂缓赴任。刻下闽省防务正急，着李鸿章即饬彭楚汉克日驰赴新任，以重地方。直隶练军，即由该督另拣妥员统带。本日有寄谕沈葆桢及文煜、李鹤年夹板印封各一件，李鸿章接到后，即着发交轮船速为分别投递，毋稍迟误。将此由六里谕令知之』。
六月丙子（初五日），谕军机大臣等：『文煜、李鹤年奏「布置海防、筹拨台防饷银军火」并「探报日本船只在五虎口外游弋情形」、「请饬宋庆统兵赴闽」各折片，日本违约称兵，昨据沈葆桢奏报到台后，业经