已而林察自虎门至，闻李定国败（详「湖广之乱」），周瑞不敢进，乃旋师。成功责察戴罪、立功名，杖瑞而后斥其职。拜张名振为元帅，以陈辉、洪旭、陈六御二十四镇隶之，趋浙江；以黄廷为帅、万礼副之，督二十镇攻广东。名振至舟山，守将巴兴臣举军降；使陈六御守之。洪旭攻台、温，守将马信、张洪德皆遣使降。成功招兴臣入思明州（互详「浙海遗兵」）。黄廷至广东，吴六奇、苏利合兵战；成功诱利降，因击六奇，大败之，屯桃花山。降将刘伯禄军鹰嘴浦，廷挥其部填濠砍栅入；伯禄大败走。遂合陈霸之师围揭阳，守者遁，廷、霸取揭阳；又攻同安，入之。惠安、南安诸邑皆克，晋宁亦降。
刘清泰在福州，再以书招成功。略言芝龙列大臣，祖母风烛，而隆武帝无顾命；灭不可议之亲而从不必然之义，忠孝俱失。语多讥刺，且震满洲兵强盛。成功笑曰：『彼以劲旅言，吾岂畏一固山哉』！时济渡方以定远大将军入闽攻成功，故清泰以为言。成功亦召诸将计进退，郝文兴、陈尧策请战；冯澄世曰：『北来之军便弓马、裕储蓄，我一失锐，人心易动，不如还也；固守厦门，水战非其利：此以逸待劳也』。成功然之。堕安平镇及漳州、惠安、南安、同安城；留文兴守海澄，敛其军还思明。
冬十月，宜尔都以宁海大将军之浙江。马信、张洪德已阴降，且送其母于成功以为质。成功遗信蟒衣、玉带、白金五千，遗其母妻皆珠帔、白金各五百；且亲诣之，阻于风涛不得达。信闻，益倾心。
芝龙被废，悔；遗书成功，使无以为念。其仆尹大目（器？）首之，因使招成功不至，则族；成功不从。
十一月，朱成功至台、温，掠昌石、定关诸处。
十二月，济度自漳洲遗书成功，譬以祖大寿、洪承畴；成功依违答之。
顺治十三年（永历十年）春正月，马信劫冯国用入舟山降，遂掠临海。
降将尚可喜在广东，使刘伯禄掠揭阳；苏茂欲战，郭遂第曰；『踰桥脱不胜，奈何』？黄梧云：『必捷』。降将徐成功旁冲之，梧大败，黄灿、林文灿皆死；惟遂第军得完。
二月，陈六御告舟山城旦哭，成功使毁之（见前）。
黄廷在揭阳为吴六奇所攻，舟师多毁；廷中二矢，走新墟。揭阳、晋宁、澄海皆失。
夏四月，济度大举攻厦门。成功使林顺以十六舟据上风，前锋韩尚亮少却。济度以大军至围头，飓风大作，满汉士卒皆瞑眩，亟使反棹，柁者曰：『外洋非江湖，不可动』。风雨益骤，舟皆坏。成功乘之，济度大败；有被风飘至金、厦者，成功殊其掌纵之。
或请于尚可喜：若攻郑鸿逵于白沙，积可得也；从之。使王进功往；甫行而与洪旭遇，大战海中。郑师齐至，进功走入港。
五月，苏茂至自揭阳；成功斩之，忿其纵施琅也。众不知，谓其枉；成功祭之，比之王恢、马谡，厚养其母妻。罚黄梧甲五百。以周全斌为左〔先〕锋镇、郭华栋（遂第易名）为右冲镇。
时成功纳马信言，将北出取浙江；使梧及苏明、王秀奇守海澄。梧怨成功，既受命，则使赖玉阴入降；犹惮秀奇，不敢发。六月，王秀奇如思明。梧饮明酒，言苏茂死，明叹；梧因曰：『成功待士如豢豕，肥则食之』！遽促其叛。明以为戏也；梧免其冑，则去发矣。其党皆操刃起；明不得已，从之。袭华栋杀之，尽歼其军。其副将康雄跳城走，梧卒追之，断其腕；卒驰去。郑纯亦从降。张协闻之，使遽告于秀奇。宵白成功，使甘辉、洪旭急追之；旦及城，居民四溃。辉顿足曰：『败矣』！张协请急援五都，从之；使陈斌、陈鹏伏于隘，尽迁五都之佽入于舟。将攻城，辉与旭谋曰：『梧志久矣，非无备也』。乃还。梧既入降，封海澄公；疏陈五事：屯海口、制小舟、夺官商、禁米艘、掘郑墓。于是芝龙祖墓皆被抉，惟所称「五马奔江」者不知所在。亦授明秩，使入北京。成功以明非叛者，养其母如故。
初，成功语诸将：『济度、李率泰皆在漳，吾乘风入闽安、取福州，则漳、泉不可守；还师以救，是自困也』。以甘辉为帅、万礼副之，率杜辉、陈斌十五镇行。甫解维而梧叛，诸将失色；成功奋然曰：『吾谋大事，岂为海澄阻乎？不行者杀无赦』！秋七月，朱成功军至闽安，守者望风遁。成功使黄廷、陈鹏、周全斌守思明州，洪旭、郑泰守金门；使王秀奇攻南桥，再战再胜，遂取连江、围福州。东壁于乌龙，绝漳、泉救；西壁洪塘及水口、北栅连江，延平、建宁、温州、台州之径绝；惟南门逼于海，不之锢。降将田胜、宜永贵守。成功并军攻乌楼，克之。城中益急，出降臣周亮工及王进于狱，询之。亮工登城射，攻兵殪；曰：『今惟南门可出耳；宜使王进潜袭之鼓山，夺其舟；李成、田胜出西门、南门夹攻之』。
是月，林忠复取永春诸邑，至于大田；寻败（详「义旅」）。
八月既望，王进宵出，旦而大噪，城中发炮以