年正月甲辰，户部奏，两淮运司去年盐支尽，将今年盐中借中给边，宜将南京文武官吏食盐俱暂停止，存积盐课，供给边储。从之。丙午，南京户部尚书张凤奏：“南京锦衣等四十二卫屯军，先因进留操备运粮等项，有妨屯种。已经奏准，放回屯种。今管操武安侯郑宏又奏，将屯军操备。乞敕南京守备魏国公徐承宗等，行令南京各卫，原屯旗军仍旧屯种，办纳子粒，不许别差。”从之。
四月辛未，漕运总兵官、右都督徐恭奏：“南京水军等卫，原运粮旗军以更替操备为言，弃撇船粮，逃躲他处。乞将前项旗军一千六百五十八名仍旧存留运粮，其缺操之数，移文南京守备官，于南京有军卫分如数选补送操。”事下户部，复奏，从之。辛巳，工部奏：“国家大计，莫先于粮运。今闻自通州以南，直抵扬州，河道胶浅，粮运艰行。宜驰文于管河道军民官，令量起附近卫所、府、州、县军民，设法疏浚，其水塘泉源亦须疏通，以济运河。”从之。
六月己未，升刑科给事中刘沐为应天府府丞。戊辰，移直隶苏州府昆山县塘茜泾港口巡检司于本县七叉港。
九月戊申，松江、苏州奏：“今年四月至七月不雨，田苗旱伤。”事下户部复视之。
十一月乙酉，徙直隶淮安府桃源县递运所于清河之南。初在河北，以水势冲激，徙之。丁未，命修南京功臣庙，从南京太常寺奏也。
十二月庚申，罢直隶苏州府知府杨贡为民。
四年三月戊戌，免直隶苏州等府秋粮、屯粮，以其地去岁旱伤故也。
四月丙寅，巡抚南直隶左副都御史崔恭奏：“复视松江、苏州二府所属，去年民田一万八千九百三十顷有奇旱伤无收，秋粮四十一万三千七百一十三石，马草十三万一千六百一十包。”上命户部豁除之。
五月己丑，设直隶徐州黄家闸闸官一员。庚寅，增设苏州府通判一员，常熟、昆山县主簿各一员，专理税粮、农务、水利。从巡抚南直隶左副都御史崔恭奏请也。
七月丙申，命修南京皇墙及内外城垣，以其久雨坍塌也。
八月丙寅，赏南京留守后卫署卫镇抚事、百户刘泰钞二千贯，以擒获强盗有功也。
九月庚辰，扬州府知府王恕迁。丙戌，升南京兵部员外郎王勤为直隶扬州府知府。甲午，升萧维贞为南京刑部尚书。
十一月癸酉，迁礼部尚书萧暄于南京礼部。
五年正月壬戌，户部奏：“去年应天府多生蝗蝻，今春农事将兴，宜预处置，委官于该地方巡视。若有发生，即为扑灭，毋贻民患。”从之。
三月壬子，免直隶苏、松、常、镇四府属县并卫所，去年被灾无征粮五十三万余石，草三十万四千余包，子粒一万一千余石。丁卯，南京工部尚书王永寿九年考满，上命复职。
四月甲申，南京内府新房多朽敝，守备内臣以为言，命南京工部修之。修南京吏部及后军都督府。
七月丁未，蠲应天、淮安等府并徐州去年被灾税粮子粒。
八月庚午，修南京工部。
九月乙卯，巡按直隶监察御史袁恺奏：“苏州府崇明、嘉定、昆山县，松江府上海县七月中暴风骤雨，海潮冲溢，漂没民居、仓廪无算，人溺死者一万二千五百三十余口。”上命户部审勘赈恤。甲子，户部奏：“直隶徐州卫攒运官军遇水冲舟，漂流粮米，不能补纳，请候次年将本卫该运京仓米内存一万四千四百九十石于通州上纳，省脚米一千四百四十九石，仍纳通州，以补漂流之数。”从之。是月，直隶扬州、淮安各奏，六月中暴雨；应天府、镇江府各奏，六七月亢旱伤稼，粮草无征。上俱命户部勘实以闻。
十月辛卯，复设饭堂于南京。永乐中，于江东等门设饭堂三处，日给粥二餐，赈济孤贫，后因岁用不敷停止。至是守备臣以为言，命举行之。壬于，修南京都察院。丁巳，直隶扬州府奏：“所属海门等县，今年春夏旱伤，七月江潮泛溢，淹没田禾。”事下户部复视之。
十二月癸酉，停免直隶苏州、松江二府所属今年被灾田地秋粮七万九千七百八十余石，马草四万一千四百八十余包。
六年正月辛丑，蠲南直隶各府卫随粮芦苇。丙辰，命修南京甲字等库及兵仗局作房二千二百间。
三月庚子，南京刑部尚书萧维贞九年考满，上命复职。
四月丙子，敕谕礼部臣曰：“皇太子年及婚期，宜慎简贤淑，以为之配。尔礼部其榜谕南京、淮安、徐州，于大小官员民庶良善之家，用心选求。择其父母行止端庄，家法整齐，女子年十四至十七，容貌端洁，性资纯美，言动温恭，咸中礼度者，有司以礼令其父母亲送赴京。”壬午，应天府江浦县民家火起，延烧江淮卫及官民房屋千余间，男妇死者三十人。乙酉，增盖南京后湖贮册库房三十间。命直隶苏、松等处，仍增织纻丝