年，台湾府知府以兰地初启，民力未充，详请豁免余租。而司中以核与原案田六、园四之数，实为减少，未许。道光七年，奏请改则，而余租更宽裕矣。
先是，台湾田赋自荷兰以来，皆征供谷。归清后，亦以此为兵糈。而谷价既贱，当事者无所获利。二十三年，改征折色，每石六八秤银二圆。当是时，市价每石仅值一圆五角，而当事者又格外诛求，兼有火耗之损。台湾县保西里人不从，几至激变。庄豪郭崇高走吁北京，诏逮知县阎炘治罪，事始息。澎湖为海中群岛，地瘠而硗，素不播稻，所产唯番藷黍稷，一逢咸雨，枯槁不收，故其地不赋，由台供之。光绪三年春，福建巡抚丁日昌奏蠲湾杂税，略谓台、凤、嘉三邑合长二百九十里，额征供谷十三万余石，而彰、淡、兰一厅两县合长五百八十里，仅征谷五万六千余石。盖台、凤、嘉开辟之地较早，税则皆沿郑氏之旧，而漳、淡、兰新垦之地，新定科则，故赋较轻也。十一年建省，以刘铭传为巡抚，沈应奎为布政使。铭传负吏才，以台湾经费向由福建协助，欲谋自给之计，振兴物产，以尽土宜。十二年五月，奏请清赋。疏曰：『窃查台湾粮课，自入版图以来，仍循郑氏之旧，每丁岁征银四钱八分六厘，乾隆元年，钦奉恩谕，台湾丁粮着照内地分中减则，每丁征银二钱。以舒民力，岁征银三千七百六十余两。及十二年，乃议匀入田园征收。其番众所耕田地，概免完赋，照旧就丁纳粮。至道光间，通计全台垦熟田园凡有三万八千一百余甲，又三千二十一顷五十余亩，谷种折地一千四百三十亩，年征栗二十万五千六百余石，租番银一万八千七百余圆。至今巳数十年，垦熟田园较前多至数倍。统计全台之额，仅征额银一万五千七百四十六两，洋银一万八千六百六十九圆，又谷十九万八千五十七石，久无报丈升科。伏维我朝轻徭薄赋，亘古所无，而于台湾一岛尤为宽厚。雍正、乾隆间，屡奉恩谕，台湾赋税，不准议加。其时海宇澄清，升平无事，朝廷以台湾一隅无足重轻。今则海上多警，而台湾为海疆之要隘，奉旨改建行省，经费浩大，今昔不同。臣忝膺斯土，目击时艰，当此财用匮乏之时，值百废待举之际，不能不就地筹划。三、五年后，能照部议，以台地自有之财，供台地经营之用，自成一省，永保岩疆。况迭次钦奉谕旨，开源节流。顾以额定之赋，应有之税，乃部库入款之常经，国家经久之至计。舍此不为，徒求邻省，虽至舌破唇焦，缓急仍不足恃。臣渡台以来，详查民间赋税，较之内地毫不轻减。而询其底蕴，全系绅士包揽。若某处有田可垦，先由垦首递禀，承揽包垦，然后分给垦户。垦首不费一钱，仅递一禀。垦熟之后，每年抽租一成，名曰大租；又有屯租、隘租各项名目。而粮课正供毫无续报升科。如台北、淡水田园三百余里，仅征粮一万三千余石。私升隐匿，不可胜计。臣现由内地选调厅县佐杂三十余人，分派南北各县。又由各县选派公正绅士数人，会同先查保甲，就户问粮。一俟田亩查明，再行遂户清丈。委派台湾府知府程起颚、台北府知府雷其达，各设清赋总局，督率办理。至于赋税之轻重，应俟丈量之后，再请旨饬部复议。维念台湾民风强悍，一言不合，拔刀相向，聚众挟官，视为常事。林爽文之变，则言升科之逼迫。以是委员下乡清查，视为畏途。且千山丛杂，道路崎呕；若非勤实耐劳之员，协同公正绅士，切实清查，无裨实际；且恐竣事无期。惟有严定赏罚，以冀成效。若各地方委员绅士等妥速办理，认真清查，臣请照异常劳绩，从优奏奖，以示鼓励。倘有贿托隐匿等情事，抑或畏难延误，即行参革。庶得实力奉行，为朝廷经久之谋，除地方吞匿之弊，裕国便民，以期有裨台湾之大局』。六月，诏可。设清赋局于台北、台南两府，以布政使辖之，命知府统理。各厅、县设分局，任总办，以同知、知县主之。
初，铭传议办清赋之时，先询各厅县。或以为当编查保甲，就户问粮；或以为即施办清丈，就田问赋。而众多主前说，且为根本之计。于是先办保甲，限二月告竣。乃以清赋之意告示于民曰：『台湾地方自乾隆五十三年续丈之后，至今开辟田园数倍于前，久未报丈升科。从前海宇升平，朝廷视台湾一岛，不足重轻，期无内患，不虑外侮，赋税一项，屡奉恩诏，格外从宽，以示绥远安边之意。现在海疆多事，台湾重地，久为外人窥伺。朝廷特设巡抚，以资控制。本爵部堂忝膺斯土，应为地方远大之谋。故招抚生番，以靖内患；筹办海防，以御外侮；清查田亩，以裕饷需。不惮劳怨，惨淡经营，一时并举，以为长冶久安之计。尔百姓等渡海迁来，当知创业不易，须为子孙立百年之业，官民一德一心，共保岩疆，同享乐土。查台湾素称沃坏，近年开辟日多，旧粮转形亏短，皆由业户变迁无定，粮额向不催收；故遇逃亡，莫从究诘。或由田园籍册失毁，户无确名，疆界混淆，土豪得以隐匿霸占，奸民从中包揽控争。或籍防番抽收隘租，或称完粮自收大租。强者有田无赋，弱者有赋无田。更有近溪田园，水冲沙压，小民无力报豁，田去粮存。种种弊端，国计民生，皆有阻碍。若不及早清查，贻害胡底。现经奏明清丈全台田亩，委派南、北两府，设立总局，