初改台湾为东都，亦称明京，以候巡狩；寻变确，复改东宁国。
成功令严，目动百万俱下。时闻其子经颇通于乳媪某昵，心恨；驰谕杀媪，则佯报命，媪东流矣。未几，媪举子，伪称经妇得之；东宁文武称贺，成功不疑。久之，或有言媪未死及举子状；成功方病，闻之怒，啮指：『吾不能令吾子，安得走人东西』！叱大将裴进思，疾取子经头。进思奉命前，请死；成功曰：『若何罪』？进思泣曰：『父子天性，某恭命后，万一藩台怒平忆子，某百死莫赎。请彼自诣麾前，面决之』！进思以二千人至厦门，忠贞旭犹牵父命当遵；进思曰：『且迟之』。未几，成功薨。病剧时，谕其弟袭舍：『辅吾少子，主东宁』！成功有子十人；经而外，有聪、明、睿、知、宽、裕、温、柔等号，皆贤。进思从洪旭以经奔丧，抵东宁；守者疑，旭脱胄示之。东宁军皆旭故部，咸走散。经入发丧，而善待其幼弟，无相左。
九月，鲁监国薨于金门。十一月，督饷郑泰有罪，见杀；其子内款。以镇将马得功攻思明，为守较周全斌所败；得功死。和兰走乞内援，合兵攻思明；思明失守，全斌北降，得封承恩伯。忠贞伯旭死之。于是北洋单，总兵陈文达等各以所部内附；而牛头门、金门诸岛之众，皆解。甲辰，阁部张煌言被执于临门之范澳，不屈死。于是东宁之职兵者，为降将郝文通。而经既立，称嗣藩；感进思初谊，特倚重。其澎湖守薛长霖，进思从子也；以义子故，为异姓云。
己酉，内遣兴化知府慕天颜加太常卿，出款东宁。五月，正、副文武二使抵澎湖。澎湖为台湾门户，相距六程；所辖三十六岛。长霖以兵部守之，为内使通款曲殷。慕所要八事，不即开诏，乃使其礼官柯平（系成功之偦父）、兵部叶亨随二使至泉州。初拟开读于演武场，以文事与武备不合，不可；又以不遣官相迎，不至。既开读于文庙，柯、叶首争：『开国东宁，非属地，剃发之制不能从。又以死内地之体未返，故降人未能即还诸；通市可商』。柯、叶先归。致书慕略曰：『盖闻天无私覆、地无私载，凡属生民之主，自宜以天下为心；使跋行喙息，咸润膏泽。顷自迁界以来，四方流离、万里丘墟，是以不佞不弹远行，开国东宁；庶几寝兵息民，相安无事。今阁下衔命而来，前移诸事，未之详及；仅谆谆迎敕为辞。夫事必前定，而后可以无悔；言必前定，而后可以践诺。大丈夫相信以心，披胸见臆，磊磊落落；固不必游移其辞。今特遣督理行台礼官兼理刑事柯平、监军兵部郎中叶亨面商委曲。不佞恭承先绪，恪守丕基；必不弃前人之烈，以图一时之利。惟是生灵涂炭，恻然在心！倘贵朝果以安民为事，则不佞亦不难降心相从，遵事大之礼。至事定之后，巡逻兵哨自当吊回。若夫沿海地方，属在执事；抚绥防御，非不佞所敢与闻』。书称「永历二十三年」（此稿为军师陈永华所撰。书中所称「前移」，系初建宁道顾□□、字南泾者曾以南宁所请割地输课诸件，内不答；安民为事，指此也）。时东宁以款曲柯、叶未隆，颇变志。十月，慕复奉命以三事责之，切在剃发受封；竟不得达。至澎湖，为长霖所不礼；疾返。
论曰：郑芝龙无子，郑芝龙有子非其子；非其子，非其姓也。地上已无姓，问之水滨。洛阳阻兵，案以「卫辄拒父」之律，当作何解？君父大小，必有说也。相传鲁监国遗腹子，为长杨王术□奉养东宁。夫遗腹，是姓而未以为姓也。□□称「永历二十三年」，而鲁遗乎？
——见原书「列传」卷之九（下）
（附）传逸
郑芝龙，以兵为唐守仙霞一带诸要害。其亲家黄徽胤已北归，密书招之；芝龙欲归功徽胤，因而自媒，遂尽撤诸守。及北师大入，徽胤不在军，不敢轻身遽款；以其众遁海外。有郑瑄者，素与芝龙通谱；入海招之，咬□以誓，拟封平国公，世奇呢哈哈番。卒其子成功拒父，乃但以□□□□。
——见原书「志」卷之三十二（中）