所拔士子来谒者，以「学为圣贤，不可汩于势利」，谆谆告戒焉。戊戌夏六月，又奏添设人员，协同稽察仓弊。发九卿会议，为同事者所抑，同前岁所奏均无庸议，应交部议处；奉旨：『逐一明白回奏』。乃奏曰：『臣才识短浅，尺寸未效；中心兢惕，夙夜靡宁。今九卿会议交部察议，蒙皇上不即处分，令臣回奏；臣闻命自天，感激无地。谨将前后情形，为皇上陈之。九卿会议曰：「红斛进仓、平斛放米所多之二斗五升内，一斗四升四合九勺四抄作正项入仓；其余一斗五合六抄之米，内给旗丁回空余米三升八合、五闸盘运折耗米二升，所剩四升七合六抄作为晒扬亏折。今张伯行不将此等项款开除，止照红斛收进、平斛放出算余米八十余万石，请添新廒」等语。臣查晒扬亏折四升七合六抄及盘闸二升原在仓内，固无处开除也。至旗丁之三升八合，愿照者照、愿抵者抵；即使尽数照出，每年不过十余万石。且照出仓外，方可开除；若本帮抵本帮之欠或他帮买抵他帮之欠，则三升八合又仍在仓内，安可尽数开除乎！此臣查之甚明，所以请建新仓廒；初非朦混具题也。又会议云：「所存烂米，奉旨赏给兵丁，折抵脚价；腾空廒座必多。又添新廒百座，似无不敷」等语。臣查去岁腾空廒座，原以备去岁新粮之用；至七、八月，廒座不敷，各仓监督纷纷来禀。是去岁廒座尚属不敷，安有余剩廒座留为今岁之用乎！又会议云：「张伯行前奏新廒并未贮米，旧仓腾空甚多。不惟余米全无着落，似较去岁之米反少；恐又有「飞毂辘子」、「出黑档子」之弊。请添员协查」等语。臣查今岁粮船未到之先，各仓呈报空廒有四、五十座；空廒多，则实米少。去岁粮旧未到之先，呈报空廒止三十四座；空廒少，则实米多。臣故曰：「似较去岁之米反少」。此今岁粮船未到之情形也。又会议云「张伯行后摺又称新廒已派四十座；旧廒即有腾空，想已无多，尚有百万石无廒可贮」等语。臣查七月间旧廒用完，新廒已派四十座，新米尚未收及一半；即算放二季，春档腾空者不过四、五十座。所以奏「旧廒即有腾空，想已无多」。此今岁粮船已到之情形也。今新廒已派九十座，尚有一百二、三十万无廒可贮；即欲请建，时已无及。惟令各仓归并，随腾随派；就今日计算，仍有百万石无廒盛贮。此臣查之甚明，并未朦混具奏也。臣查一时有一时之情形，去岁与今岁不同、今春与今秋不同。臣随时具奏，无非慎重漕粮之意、初非敢前后朦混、任意矛盾也』。疏上，九卿无以难。
庚子十月，奉旨管理钱法。旋补授户部右侍郎，兼管仓场总督。辛丑春，钦点会试总裁，得士储大文等一百七十余人。秋九月，河南马营口决，上命河南人知河务者具奏；乃具摺奏曰：『臣籍隶仪封，去黄河三里；故黄水之性，最为留心。盖黄水不两行，若有两条河，水行一条，必淤一条。故一遇冲决，水分新河，旧河必淤。若旧河仍行者，则新河不过因水势泛涨，泄其有余；水一消落，仍行旧河；此自然之势也。今武陟县冲决河口，不过因黄、沁并长，泛滥溢漫，泄有余之水耳；黄河之水仍旧东行。入冬以后，水势消落，势必尽归旧河；稍加堵筑，即复旧矣。独是山东运河，只借一线泉水；遇天道亢旱，泉源干涸，寸步难行。臣前任济宁道时，会议引沁河之水以济山东之运；后以升任，故未及行。今岁粮船浅阻山东，将至迟误；而黄、沁交会，忽冲一缺口，直入张秋，运河粮船尽皆抵通。是今岁之运，赖此冲决以济之也。若由此修治，引之济运，便可成万世之利』。越数日，接驾；蒙温旨云：『前所奏河务，与朕意甚合』。又召进行宫，论河务；面奏『于黄、沁交会之际，建闸筑坝，重重关锁；使不泛滥。一引沁由贾鲁河以入济济运，一引沁由新决之河入张秋以济运。张秋东崖五空桥安放闸板，水小则下板引沁济运，水大则放沁入海。至于济宁运河之西，再建闸一座；水小则引沁济运，水大则下板引沁入湖。不但粮船遄行，而临河之田皆成膏腴矣』。冬十月，以母病请归省；奉旨准假，并命以便道阅视河南武涉决口。先生兼程抵家视汤药；母耿太夫人喜，疾顿廖。遂遵旨相视河工，如期复命。壬寅春正月五日，奉旨赴千叟宴。宴毕，偕诸年老大臣至干清宫谢恩，赐坐；奉谕旨：『汝等皆大臣，当抑体君心，惠爱百姓。如张伯行为巡抚时，地方情形、米麦价值皆不时奏闻；是真能以百姓为心者也』。
先是，仓场积弊甚多；先生剔厘，不辞劳瘁。既而兼理钱法，旋升户部，府库、仓储尽以委任于先生，政务日繁。先生感知遇恩，竭力图报，昼夜废寝食。时又奉旨发仓减价粜卖，开厂数十处；先生亲往来巡查，奔走道途。于是精神、心力，销耗殆尽。冬十月，召对澹宁居，眩晕色变；圣祖命少司寇阿公、总漕张公扶掖出，寻愈。十一月，圣祖升遐，先生感高厚恩，哀痛迫切。二十七日尽礼，无稍懈；梦寐中，时泪涔涔下。今皇上御极，深知先生公忠为国之心，又以先朝旧臣，特加眷顾，锡予每逾常格；谓先生年老，事难兼摄，命专理户部及钱法堂。腊月二日，命同满、汉大臣十三人至先帝梓宫前举哀；特赐素珠一串曰：『此先帝所遗留也』。嗣后会议大政、保举大员，时命随亲王大臣在干清门预议。