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十七年（本作「大清顺治元年」，此从王编原本）（甲申）
先生四十有三岁。
春，病发抵家，疾益甚；具疏请休。三月初旬，闻请不允。二十六日，力疾赴南畿。至吴门，闻李贼犯京城急，或劝且引病观变；先生曰：『时危，则君臣之义愈切；引疾不在此时也』。遂兼程进。帝后既殉国，凶问至，北望号恸，遂绝口不言疾。
四月，福藩避乱至淮，序当立；先生亟同史公可法等至舟次迎入南都，谒孝陵，居内守备府（按「明史」「福王传」：『四月庚寅，称监国；壬寅称伪号』。「明史稿」本传云：『五月朔，福王谒孝陵。越三日，监国』。今从「明史」）。王召诸臣议战守策；先生曰：『战守固今日要事，然纪法为立国之本、人心为纪法之本。亟宜颁大赉，以固人心；涣大号，以明纪法』。侃侃数百言，听者竦然。诸臣援宋高宗故事，拟以王为「兵马大元帅」；先生曰：『监国，本朝故典也；何远引为』！议遂定。诸臣方上「监国」宝，而侍郎吕大器初主立潞王，及是惧祸，欲献媚，请以后日即正大位；先生抗言曰：『监国，名极正。今日监国，明日登极，事如儿戏，何以服人心、谢江北诸将士乎？且群帅劝表未至，即有忠如陶侃者，尚以不豫定策为耻；况其他乎！既监国，则君臣分定。请俟王德及人、诸帅推戴而国服亦满，斯时始议其仪，未晚也』。从之。又二日，疏陈致治大本，语甚剀切；王嘉纳之。是时群小欲以正位邀功，驾言史公阻挠有二心；史公惧，不敢坚主先生议。先生又上三事于阁臣：一、先帝殉社稷，须崇美諡；一、监国选后妃，须俟圣母迎至后；一、臣子遇非常变，不可藉是逾格升迁。众议欲授先生节钺（按毛传：『可法虽是彪佳言，不敢持；遂以民变，谓彪佳素德苏，出彪佳安抚苏州』。今从「旧谱」），先生不可；又欲循格转京卿，先生曰：『予台资十三年，卿寺固非越分。但乘变转阶，义不忍为』！因自请仍旧衔。
适高杰兵扰扬州，士民奔避江南，奸民乘机剽敓；廷议以先生尝按吴、有威望，遂推往宣谕。初八日，命下；次日，行。抵句容，闻吴城昼闭；先生露布郡邑，言「国已有长君，今奉命安抚」。吴人闻先生复临，皆惊喜相告。时天久不雨，先生至，即步祷赤日中，雨大沛；人呼为「军门雨」。抵京口，即设先帝后位，集绅士哭临；并以「江北固守，中原无寇」播告所属，出见难民，多方安辑。次日，大集郡人，遍询地方疾苦，释狱囚之可矜者数十人。至丹阳，宣诏，首举忠孝大义；且榜于途曰：『叛逆不可名，忠义不可矜；有借锄逆以逞私怨、借勤王以聚匪徒者，法必诛，毋赦』！时械乱民至，立斩三人。抵宜兴，士民焚香迎数十里，先生停车慰劳之。入县，枭逆奴数人以徇。所至宣布赦文，甄别有司贤否；于是诸邑倡乱者皆敛迹。
王既称号后，迁先生大理寺丞，擢右佥都御史，转苏松督。疏辞，请终安抚事；遂巡抚江南。及抵苏州，合属迎谒；首以「忘身乃保身、忘家乃保家」二语谕之。苏州诸生以其乡少詹事项煜等从贼，作檄致讨；奸民和之，焚劫煜与大理寺正钱位坤、通政司参议宋学礼、礼部员外郎汤有庆四家，荡洗无遗。先生置首乱者于法。常熟乱民亦以时敏从贼，焚毁其三代四棺之未葬者；先生斩三人、鞭死数人，乱始定。因上言请将从逆诸臣议罪，使士庶无所藉口，则焚掠之徒可加等治；王允其请。嘉定令恃虚名狂恣，遽斥之；松江别驾朱某贪纵，庭褫其冠，禁之狱：人大快。嘉定华生拷奴酷，遂激变；各大姓奴同时起，缚主杖之，踞坐索身券，或杀、或辱。所至数万人，百里内如沸。先生密发标兵，授苏道方略，悉擒之，斩凶首数十人，磔尸；令曰：『故主乞哀者贷死』！于是诸奴亲属皆膝行搏颡主庭，愿纳券，服役如初。
六月二十三日，抵苏松巡抚任。疏言：『国难方张，贼仇未复；皇上为乾坤再造之主，微臣有股肱三辅之任。以地形，则负海枕江；以民力，则三空四尽；以习俗，则士嚣民顽；以吏治，则文恬武嬉：整顿最难，补苴无策。臣于此不敢自有其身家，惟与士民共身家；不敢自有其性命，惟与将吏共性命。夫身家尚不自有，又何有货贿！性命尚不自有，又何有情面！此臣剖心沥血之诚，可矢诸天日者也。惟是赋才既庸，具识复闇；军旅未习，学问未深。共济必藉夫贤才，固圉必资其劲旅；凡请补将吏、调济军需，自当勉图其所急，要非旧贯之可拘。倘不稍宽文法，恐难转布微诚；如掣肘之未除，纵鞠躬而无补。伏乞言无微而不收，事有呼而必应；庶涓埃可效，而驽力可勉也』。疏入，识者以为切中当时情事。
有吴遵者，谋不轨，禁之县狱；每言愿见先生，有所陈而死；为先生所拒，不得见，则以吴昌时往来密札，令其子献之朝。先生命县令索毁之，曰：『吾不为已甚也』。
二十八日，出誓师，以上下名分激励将帅；每一出语，涕泪横流，将士呼声动地。召募兵勇，中上格者为冲锋兵，得百人；次为选锋标兵，得五百人；有绝力而知兵法者拔为亲将，得二十人：一时壁垒为南兵之冠。
诏设厂卫缉事官，先生上言：『洪武初，官民有犯，或收系锦衣卫，当