分防各省，皆数十万。永历诸将削平，大兵凯旋在即。我分兵以守，埶弱不足当；庶神速取南京，得形胜、守要害，传檄天下反正勤王，定国等不召自至。南都未得，譬诸堂奥空虚，何淮、扬门户之有』？遂使周全斌、高谦益兵守镇江京口，杨朝栋招抚江南，袁起震、徐春招抚江北。有陈文达者，统战舰二百余艘来归，授指挥乡道使。时延平声势大振，旬日之间，江南北相率迎降：府若太平、宁国、池、徽，州若广德、无为、滁、和，县若当涂、繁昌、宣城、宁国、泾、黟、南陵、太平、旌德、贵池、铜陵、东流、建德、石埭、青阳、含山、舒城、巢、沛、庐江、高淳、溧阳、建平、句容，分将抚安，若虞不给。常、镇、淮、徐望风引降，文武弃城奔走者络绎不绝。而内大臣达索为安南将军，会都统索洪、护军统领赖塔等统大兵二十万来援。
成功遂进取南京，至观音门（江宁外郭，北面三门，最西曰观音），令黄安总督水师泊三汊河口（三新河口，近草鞋夹通口）。成功由仪凤门登岸（西出从北第一门，在三汊河口东北），率诸将观钟山形势，祭太祖列宗而还（钟山在府治东北十五里）。令甘辉、余新屯狮子山（府西北二十里，亦名庐龙山）；万礼、杨祖屯桥山上，洪天佑为援；马信、郭义、黄昭、萧拱宸屯汉西门；陈魁、陈鹏、蓝衍、蔡禄屯东南隅，结水寨；刘巧、杨正、戴捷、刘国轩屯西北隅，环山为营；而自帅张英、陈尧策、王秀奇、林习山等屯岳庙山，与诸镇营垒云连势结，首尾相迎。
巡抚蒋国柱率将士数千骑薄营，余新徼之，大败，单骑遯，复为游卒所擒；见成功，呼万岁，怜而纵之。郎廷佐、管效忠等方议降未决，会崇明梁化凤及参将张国俊、游击徐登第等各率水陆兵数千闲道至。国柱、衣祚依化凤，突围至城下，缒而入，与总督廷佐巡城雉，东北隅敌营少备，闻大兵旦夕将至，议出奇夹击。衣祚曰：『是有门曰神策（在太平之西、金川之东，是年因胜成功于此，改名得胜）』；化凤大喜。
秋七月，贵州凯旋，副都统噶褚哈、马尔赛等由荆州浮江赴援。陈魁等逆战，大败之。壬戌（初三日），都统刘之源统水师数万与噶褚哈等合击魁、鹏等众，蓝衍、蔡禄撒油豆敌舰上，而众以矛搠乘之，溺毙过半，水为之塞。甲子（初五日），都统哈哈木等统水陆师会战，余新、洪天佑分兵拒击，张英、林胜督铁人截攻。陆路北师见矢刃不能伤，而斫足竞前莫却，骇避入壁；水师又为天佑等所败。
延平屡胜，兵益骄，诸将争功互相讦。成功令：『非有令擅自进取者不为功，越营争胜者功叙本营，他营非危急不得相救』。庚钟谏曰：『将士奋勇贪功，勿苛责以挫其锋。且敌兵已数十万朝夕益至，吾军止有此数，非连营速战、乘胜合攻不可。都城久围不下，或有他虞。诸城降纳不足守，胜则速来，败亦速去。为今日计，不如发令诸镇并力，水师争先取胜，以吾所长、攻彼所短，果能尽覆其水路诸军，歼其渠帅，横江寒隘，则陆路军亦胆落神飞，而后乘锐并力，靡不济矣』。不听。
庚午（十一日），达索等大兵继至，分兵会战水营，而分陆路兵渡江攻击。延平诸镇各自为战，势已不支；且北兵蜂集云奔，见胜则进，小败即退，朝夕更代，以逸击劳、以饱击饥、以多击少。如是者旬有五日；延平士卒日疲、器械日敝，气衰粮匮，累败欲崩。庚钟曰：『势急矣！速令并力自全，相机退守，以图再举』。又不听。
甲申（二十五日）夜，化凤等率精骑穴城出，攻余新营；北军夹之，遂擒新，尽俘其众。连攻拱宸等营，连破之。及万礼等奉令来援，而化凤已入城去。甘辉及庚钟谏成功退屯观音门，连营合陈，不必待令，争相救护；又不听。
乙酉（二十六日），达索统大兵围击甘辉、张英，索洪围击林胜、陈魁，哈哈木等分取姚国泰、杨祖、蓝衍、杨正，而水师诸镇为刘之源大兵所围，桥山寨为赖塔等所围，西北刘国轩诸营为噶褚哈大兵围守，岳庙山诸屯又为马尔赛、张国俊、徐登第据隘环攻。成功张黄盖山上，望大兵无不以三围一、以十并二，神器雷轰，矢石雨注。方急遽不可为计，而郎廷佐、梁化凤各选精骑表里合击，锋锐不可当。乃令庚钟代盖下指挥，自趋江下整舟师合战，而被所焚溺已五百余舰，触折渗损无计算；急帅周全斌、刘猷、杨富冒矢石冲坚力战，拔诸将出排沙屿。瓜镇已破，前降诸府县守者多亡失。潘庚钟、万礼、张英、林胜、陈魁、蓝衍、李必、魏其志力战死军中，甘辉、余新被擒亦死，收残卒亡归者什不二三。成功大恸曰：『悔不用诸将军言，败弃若是』！欲自刭以谢死者；全斌及诸将泣谏乃止。遂缟素哭祭，悲号咽江，躬巡吊恤，抚创痍，遣使奉表永历，请贬王爵。
八月，次吴淞港，遣蔡政賫书马逢知所。都统刘之源为镇海大将军，驻镇江。
庆阳王冯双礼兵败，走四川，德安侯狄三品执之北降，授三品抒诚侯。济安伯朱养恩等以嘉定州降北。巡抚高民瞻兵克成都。
成功攻崇明，梁化凤以炮击死正兵镇韩英、监督王起凤等，遂退。九月，师还思明。前使永历者道阻反命，诸将请仍王号。
冬十月，刘猷往