景崧改名曰「章」）。绅民入抚署鼓乐赍送者百余人，行两跪六叩首礼。国旗蓝地黄虎文，长方五幅；虎首内向，尾高首下。改台湾藩司衙门曰「内部」，设内部大臣；筹防局曰「外部」，设外部大臣；别立「军部」，设军部大臣；台湾俯、县等官，改署有差。炮台升虎旗，开炮二十一门。申刻，英商轮「康姆萨」出沪尾口，台湾藩司顾肇熙、台湾知府管元善、淡水县知县李淦皆乘以内渡。船内有洋商七；倭兵轮来追，有倭酋率兵数十名登轮搜索，并探台中动静；英船主告以皆商人内渡并台湾自主诸事，倭酋去，始展轮行。
初三日，福建提督杨岐珍撤兵内渡（岐珍所部十二营，至初七日始毕渡；岐珍于初七日乘「南琛」内渡）。于是前敌兵备益单，基隆防兵仅绍良所部及土勇四营；其东路三貂岭、澳底诸处，无兵驻守。初五日，倭兵轮、运轮二十九艘驶抵台北海面，分泊基隆口外澳底、金包里；沿八里坌、大始崁迤逦至沪尾，凡可登岸之处皆有倭输。初六日，倭兵轮并力击我金包里（值基隆澳西岸），张声势，作欲登状以缀我（我师驻金包里者六营）；而潜结教匪、挖金砂匪从澳底登岸。澳底本驻有岐珍防营；至是撤兵去，易以曾喜照（张兆连部分统）。喜照新募土勇两营，成军甫三日；遇敌不战，溃。澳底值基隆东稍北，当八斗澳西岸，煤厂、金砂诸厂环其后。盖基隆一澳如狮之张口，仰向西北；澳西为金包里，澳东为平波岛（岛南与社寮隔一港）；平波岛如狮额，其顶为全台极东北角；循额而东、折而南作海湾，曰八斗门湾；再循海而南，曰八斗澳；再南迤东，曰劈岛角（原名鼻头）；再南迤逦至苏澳，则台湾全岛之东岸矣。八斗澳南隅曰澳底，西去基隆五十里，路崎岖；中隔三貂岭，过岭分大小两道：大道通瑞芳达基隆，小道则通吴朱埕、暖暖街达八堵，已绕及狮球岭后（狮球岭为台北省会屏幛，光绪十年刘铭传据此守基隆拒法人，台湾卒全）。此由澳底西行山道；若循海岸行，则过庚子寮、踰九芬山，即抵社寮炮台。于时登岸倭兵才二千人，若以兵严扼三貂岭，可聚而歼也。乃三貂无一兵，瑞芳、九芬防兵亦单薄不足当大敌；倭人留兵稍守澳底，其全队遂循山路进。初七日，前锋过三貂岭，驻岭背梁绅庄宅。先是，景崧闻倭人登岸警，电令吴国华率广勇七百人往守三貂岭（国华募勇广东，久乃集。四月，率三千人渡台，而虚籍复多，实祗及二千人；乘民船渡，遭风，收鹿港。永福截其众驱赴台南，其得抵台北者乃乘「新福建」轮船之七百人，仍多虚额）。国华新自广东至，仓卒部署；初七日已刻，始率四百人先行。初八日未刻至小楚坑，适倭人探兵从三貂岭来探瑞芳大道并绘图，骤遇国华军，遽搏战，团勇夹击，枪毙三画倭酋一，遂反奔；国华追之，乡民拍手欢呼。是时，景崧复令营官胡连胜（广西人，友胜之弟）等援基隆，且调顶石角营官陈国柱、金包里营官陈桂波、狮球岭营官知县包干臣等各率勇敢数百人赴前敌助战；皆称统领，无所系属，前敌兵事益不可为。国华猝遇倭兵于小楚坑也，干臣率三百人往助战。至则倭兵已遁，不继国华进蹑，而与团勇争倭酋首级，大哗；干臣缚团勇指为汉奸，将杀之；时国华追倭已至岭巅，因雨待棚帐，尚未驻营；闻报知干臣将持首级夺其功，大怒，撤队驰下岭；干臣见国华还军，藏首级竹簏中，遽拔队回；国华尾其后，俱还基隆，遂弃三貂岭不守。干臣竟以大捷闻景崧，省会官绅毕贺。是夜，仅土勇一营、绍良部淮军两哨分驻瑞芳。四更时，倭兵冒雨登三貂岭；于是，基隆东道藩篱尽撤。
初九日，景崧电令前敌分三路进，图复三貂岭。一由大路从相思岭、龙潭浦、瑞芳过九芬桥、小楚坑直抵三貂岭为正兵，专责国华；一由暖暖街小路至吴朱埕绕出三貂岭之左为奇兵，专责游击杨连珍（岐珍之弟，留台充小基隆分统）；一由海边社寮炮台循八斗口、庚子寮度九芬山截其归路，责金包里分统李文忠。期以申初，会基隆齐进。讵我诸营未集，倭兵已分两队踔至：一扑九芬，一直抵瑞芳；别队扼吴朱埕北，防我军包抄。九芬近海岸，且兵单，倭人已移快炮登岸猛击；战移时，宋营官死焉，哨官丧三人，孙营官受殊伤，九芬遂陷。瑞芳闻之，大震。
先是，广东守备刘燕率炮勇三十人督格林炮五架扼瑞芳西面土山，营务处俞明震以景崧令来观战，亦在焉。瑞芳四面皆山，形如釜底；前早甚雨，适国华率营至，未筑垒，入驻金砂局。敌至乃出队，逼于地势，拥遏不成列；而倭人列队东西两山顶，每队八人，甚严整（如德国兵制之散队小排）。东面距三貂岭四里，倭人先驱教民降虏下岭，进扼九芬桥，约千余人；我军遽开枪，敌伏不动。一时许，俟我枪弹耗，始大呼过九芬桥；而山顶倭人乃发枪弹及金砂局。时已昏暮，倭燃电灯明如昼，我军皆惊。国华不得已率队进，争九芬桥；倭人先于涧旁伏我奸民，俟国华至，突起来犯，死伤二十余人，我军哗溃不能止。倭乘势薄瑞芳，刘燕督炮队自西面发炮下击，弹雨下，敌死十余人，复退去。是夜大雨，国华竟拔队回基隆，弃瑞芳不守；倭亦疑畏，未至。四更，张兆连率护卫营冒雨至瑞芳。初十日辰刻，国华、