者〕，有繇（由）水浮回者，有被左冲载回者，惟查不见大将甘辉、万礼、林胜、陈魁、张英、蓝衍、副将魏标、朴世用、洪复并户官潘庚钟、仪卫吴赐等回。藩叹曰：『是我欺敌之过，轻信余新所致也。然胜败常事，亦何虑□□』。吊（调）常镇道冯御史、右武卫周全斌、后冲镇黄昭并瓜州地方柯平、援剿后镇刘猷等俱各在船听令，别作良图。
二十五日，议正杨祖、杨正、姚国泰等失机之罪，令枭首示众，后诸将劝免，杨祖、杨正暂管事，姚国泰发刑官监候。
二十六日，令右武卫收拾左武卫官兵；令前协裴德、副领兵林瑞、刘国轩等管束右虎卫，收拾左虎卫官兵；令前协郑仁、后协陈蟒等管束□□，□□□□□□；令右提督收拾五军骁骑镇官兵；令中军虞允升协理，黑云祥等管束□□□□；令中冲镇收拾前锋镇官兵；令右冲镇、宣毅左镇收拾后提督官兵；令右镇颜□□□后劲镇，收拾中提督官兵；令右镇李昂、亲随营林正管束□□□，□□□□□□；令宣毅后镇收拾前冲镇官兵。
朱逷先先生曰：『南京之战，所占篇幅甚长，然其载甘辉之谋，仅得其片段，而又不甚明了。夏琳记甘辉之言则较完备。闽海纪要卷上曰：「瓜镇既破，甘辉进谓成功曰：瓜镇、南北咽喉，但坐镇此。断瓜州，则山东之师不得下；据北固，则两浙之路不得通，南都不劳而定矣。成功不听。将进兵，甘辉又请陆路而行，以为乘破竹之势，一鼓可下，或攻取其附近州县，以绝援兵，则南京势孤，自必难守。若由水路，恐风信稽迟，援兵四集，又费工力」。南京之战，以甘辉为最重要人物，而谋画及其死节，皆不为之详载，故闇然而无光彩也』。
二十八日，派程班师驾出长江：一程本藩文武各官亲军四镇，二程左冲镇、宣毅后镇、后劲镇、左提督、中冲镇、中提督、□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□左先锋、援剿右、后提督、宣毅左、右冲镇、□□□□□□□□□□□□□□□冲镇、援剿后等断后，并专押运粮船，右提督、正兵镇先行堵口。
八月初一日，师回至狼山，上沙时，粮运船多重载，不堪驾驶，委户都事杨英分派各中军船并各提督统镇船只运载，预作兵粮。各船俱满载，粮船放回，赐手梢各路粮千余石。
初四日，师泊吴淞港。遣礼都事蔡政往见马进宝。进京议和事机宜，俱授蔡政知之。亦无书往来。
初八日，舟师至崇明港，集诸将议曰：『师虽少挫，全军犹在。我欲攻克崇明县以作老营，然后行思明吊（调）换前提督等一枝，再图进取。一则逼其和局速成，二则采访甘提督等诸将生死信息，三则使虏知我师虽败，尚全力攻城，不敢南下袭我。诸将以为何如』？众签曰：『可』。于是随派防水师并攻城官兵。以左冲镇黄安督配援剿右镇、前锋镇、右虎卫、左武卫、协将裴德、五军、左虎卫等共战舰十六只，提调罗蕴章防御七了港口，泊白米沙外洝。以援剿后镇刘猷、宣义左镇万义、中冲镇萧拱辰、右冲镇万禄等共战舰十二只防御吴淞港口，泊新兴沙外洝。以右先锋杨祖、后劲杨正督配中提督、前冲镇等防御狼山上流，泊王家港。各分遣防守去讫。
初十日，传令登岸札营，攻崇明县城，派定处所：
一、右武卫堵攻西门，并护大炮；
一、宣毅后镇堵攻北门桥；
一、正兵镇堵攻东北角；
一、后冲镇堵攻西南角；
一、右提督为各路应援；
一、左提督札土堡为老营，接应北门；
一、伙兵限初十夜俱到城下，照所分汛地在河沟干呐喊，分其铳路便安籧篨。
十一日早辰时开炮，至午时，西北角城崩下数尺，河沟填满。藩亲督催促登城。守将梁华凤死敌不退。时正兵镇韩英勇壮登城梯，被铳伤中左腿，跌下。矢石交加，有如雨下。监督王起俸亦被铳伤而退。藩见城坚难攻，传令班回。越数日，韩英死之，王起俸亦被伤而亡。时本藩又欲吊（调）集诸将前来攻打。右武卫周全斌言曰：『此城深沟高垒，梁华凤请加守援，已难骤拔。况官兵被创之余，昨日韩英被伤，闻者寒心，无意恋战。且得此孤城绝岛，亦是无益，不如渐回旧汛休养，号召精锐，候明年再进长江，以图大举，未为晚也。伏请睿裁』。藩从之。随传令班师。
是日晚，适马提督差中军官同都事蔡政至营，言：『马提督因闻大师攻围崇明，特遣中军前来说和，称：「既欲奏请讲和，仍又加兵袭破城邑，教我将何题奏？贵差将何面君？不如舍去崇明，暂回海岛候旨，成否之间，再作良图，亦未为晚」』。藩谕之曰：『尔酋等大张示谕，谓我水陆全军覆没，国姓亦没阵中，清朝无角逐英雄之患，吾故打开崇明，安顿兵眷，再进长驱。尔主其亦知之否？我今搀施数铳，其城已倒及半，明日安炮再攻，立如平地。既尔主来说，姑且缓攻，留与尔主好题请说话也』。令人同看营中兵器船只整备，叹曰：『京都覆没，岂有是耶』？藩随令搬营在船。
十二日，遣蔡政同马提督中军再回吴淞，往京议和。
十八日，藩督师回至林门。传令左武卫、左虎卫、中后提督