多领他司，寓直其中。
元丰五年，职事官贴职悉罢。及官制行，立为定员，厘正其事。分案四，设吏八，太史局隶焉。《哲宗正史 职官志》同。
神宗治平四年即位未改元闰三月，御史吴申言：「窃见先朝宰相韩琦等所荐十人试馆职，而开封府界提点陈汝羲别以奏对称旨，亦与试，渐至冗滥。兼所试止于诗赋，非经国治民之急，乞参用两制荐举，仍策以经史及世务，勿用诗赋。」诏两制详定以闻。其后翰林学士王珪等言宜罢诗赋，如申言。乃诏自今馆职试论一首、策一道。
熙宁二年十一月三日，置崇文院校书，始除河南府永安县主簿邢恕。乃诏今后应选举到可试用人，并令崇文院校书，以备朝廷访问差使，候二年取旨，或除馆职，或升擢资任，或只与合入差遣。
三年五月十六日，诏崇文院校书邢恕与堂除近地试衔知县。先是，同知谏院胡宗愈言：「崇文院校书如未历外官及不满任者，不得选举。昨邢恕以新进士除校书，盖是朝廷未有法制。近闻新进士缘此奔走权要，广为地道，乞自今须历任乃除。」故上令罢恕。
四年十月二十九日，集贤院学士、史馆修撰、判秘阁宋敏求言：「伏见前代崇建册府，广收典籍，所以备人君览观而化成天下。(令)[今]三馆、秘阁各有四部书，分经、史、子、集。其书类多讹舛，虽累加校正，而尚无善本。盖雠校之时，论者以逐馆几四万卷。卷数既多，难为精密，务在速
毕，则每秩止用元写本一再校而已，更无兼本照对，故藏书虽多而未及前代也。臣欲乞先以《前汉书 艺文志》内所有书广求本，令在馆供职官重复校正。既毕，然后校后汉时诸书。窃缘战国以后及于两汉皆是古书，文义简奥，多有脱误。须要诸本参定。欲乞依昨来校七史例，于京师及下诸路藏书之家，借本缮写送官，俟其究精，以次方及魏、晋，次及宋、齐以下。至唐则分为数等，取其堪者则校正，余皆置之，庶几秘府文籍得以完善。」事竟不行。
六年八月九日，诏祠部员外郎、集贤校理、同修起居注刘瑾为史馆修撰，充河北都转运使。史馆修撰带出自瑾始。
七年，诏置补写所。
六月二十二日，监三馆、秘阁言：「看详崇文院孔目官孟寿安所陈诏书内求访到书籍只各一部，并未校正，乞行校正。仍差见补写楷书二十人，将上件书抄写四部，均送逐馆。乞应街市镂板文字，供录一本看详。有可留者，各印四本送逐馆，合用纸墨、工食钱依例下度支支。乞不令诸处指定取索馆阁书籍，并可与施行外，欲将借本书库原书籍添入经、史、子、集，书数足备及准备阅览。其馆阁书籍浩翰，若依所乞，虑难抄录。科场借书，外面无本，方许于馆阁权借。如遇殿试科场，即馆阁一面供书入殿。」从之。
元丰元年十二月七日，秘阁校理苏梲言：「每岁崇文楷书补写四库书，只令吏人比校，或致差 。乞应在馆诸官点
检校定，而冀官各任责，兼足以讨论百氏之书，开广闻见，遂命崇文院勘会四馆书籍。昨因置编校所，逐馆出借书籍供应校证，多拘收不到。应校勘官因此呼(嗦)[索]不系陪填蛀(贡)，补充逐库书籍，却成交互。欲乞校勘官只许将已写未装及蛀秉书看校，不许带出。」从之。
二年四月十八日，翰林学士、右正言章惇判秘书省。
二年十一月十六日，集贤校理王子韶言：「阁宿官遇假日不许设火，亦无灯烛。缘旧日遇假，多寡豁宿寡：疑误。。近来不许豁宿，冬月寒冷，宿直不便，乞依班房例虽遇假休量与给火。」从之。旧制，当宿官房听留灯火。
四年十一月，诏太中大夫待制以上带修撰者并罢。是月，废编修院，入史馆。
五年四月二十三日，诏：「自今更不除馆职，见带馆职人依旧。如除职事官校理以上转一官，校勘减磨勘三年，校书减二年，并罢所带职馆职。」旧例，校理以上到馆二年与通判，三年与知州。郎官已上遇大(理)[礼]，许奏荐，及校勘已上每任堂除，到京请给俸供职，不常参，不入川广，杂压官同以职支破职食钱及御厨食之类，今既不除，此例悉罢。
四月二十六日，太中大夫、龙图阁直学士、判将作监王益柔为秘书监，奉议郎、集贤校理、知太常礼院林希为承议郎、行秘书省著作佐郎，宣德郎、馆阁校勘林希为秘书省校书郎。秘书监及著作佐郎、校书郎初除，故具载之。正字准此。
五月十一日，诏秘书省于三省用
申状，尚书六曹用牒，不隶御史台六察。如有违 ，委言事御史弹奏。
八月四日，诏秘书省听御史长官若言事御史弹奏。先是，置监察御史，分六察，随所隶察省曹寺监，而三省至内侍省无所隶，故长官、言事御史察之。
十月十二日，诏秘书省正字以上中书省差。
十一月十五日，宣德郎邓忠臣为秘书省正字。
六年三月四日，诏秘书省长贰毋得与著作修纂日历事，进书奏状即系书。其关防漏泄，并依旧编修院法。
六月四日，诏集议大典礼，令秘书省长贰与。
九月十四日，诏秘书省依诸司遇大忌