清二年，建寺曰灵山，寻改大云。唐初更隆兴，开元二十三年更今名。复匾其门，曰“芝山”。会昌中，汰天下寺，州存其一，即此。北宋天禧中灾。庆历二年，合开元、庄严二寺地重建。国朝为祝圣之所。南有亭，石柱十六。亭之南为灵源阁，廊东、西有钟、鼓楼。其东平怀堂，后唐同光初为太平寺，闽王审知建，以铜三万觔范弥陀像于灵、芝二山之麓。下有古井，深不可测。縻金银万余两为四藏经，各五千四十八卷，翁承赞撰“铭”。又造木塔七层，宋时屡灾，并入开元。
唐周朴《开元寺》诗：“开元寺里七重塔，遥对方山影拟齐。杂俗人看离世远，孤高僧上觉天低。惟堪片片紫霞映，不与濛濛白雾迷。心若无私罗汉在，参差免向日虹西。”
明王恭《题冶城开元寺》：“城里青山闻梵音，灵源高阁影沉沉。鸟边祗树人烟近，象外云花野照深。苔色满廊行履迹，月明空界印禅心。自怜人代多氛垢，未得焚香礼遁林。”张潜《开元寺》：“偶入菩提门，徙倚灵源阁。抬头眼境宽，适意胸襟廓。四山当衽蓆，千里在掌握。金容照寰宇，璇题俯城郭。影移雾刹幢，声落风檐铎。霜林出断鸿，霞空送孤鹤。岳峙天齐年，海晏民同乐。吾人大化中，内观须不怍。”汪文盛《开元寺纳凉》：“佛照明珠海，慈云起鹫林。禅超三乘悟，阁抱四天阴。劫外缘无了，风前乐自吟。万山绕闽粤，豺虎只徒深。”(文盛，湖广崇阳人，嘉靖初知福州。)邵傅《避暑开元寺》：“三伏城中寺，灵源宝阁幽。客来能几度，芝化已千秋。松径风涛入，莲池水月留。翻嫌河朔饮，未卜此岩丘。”吴国伦《过开元寺》：“芝林歇马叩文殊，贝阙阴阴复道纡。绕院风灯摇罔象，半山羽盖拥浮屠。晋安城郭千花簇，蓬海烟沙一雨驱。只讶诸天常不夜，摩尼隔水弄明珠。”(国伦，兴国州人，知邵武府。)郭子章《开元寺》：“空境凌空势欲齐，万家烟火引招提。海澄定水潮常寂，山浴慈云瘴不迷。石鼓遥临仙梵逈，灵芝倒跨堞楼低。禅栖市隐嚣尘绝，白社何劳问虎溪”。赵世显《开元寺》：“结侣恣跻攀，空门俯市阛。秋声摇翠竹，爽气溢苍山。树杪诸天静，云边独鸟閒。幽怀耽木石，逸思出尘寰。日落孤城紫，烟凝万井殷。漫馀山简兴，倒载月中还。”
灵山堂 在芝山之东。旧为开元寺经院，有僧纲司。嘉靖间，高侍御世魁丐为别馆，后入方序班增构亭榭，侍御殁未五十年，已数易主。
明汪文盛《过经院读郑继之壁间诗》：“瘴雨炎蒸午未深，斜穿曲径过禅林。灵山日傍孤城转，闽海云生废殿阴。苦忆旧游谁在眼，读残新刻倍沾襟。抱琴那有钟期想，挂剑徒悬季札心。”林炫《饮灵山堂》：“高适夙抱烟霞兴，别业新开山水奇。洞口仙人骑白鹿，峰头童子采青芝。晴云起石斜依户，春水滋花细入池。万卷悠然堪习静，红尘车马任奔驰。”朱豹“次韵”：“寂寂山堂带梧竹，疏簾小簟故清奇。晴云出岫绕苍石，老鹤穿花衔紫芝。招隐自甘黄蘖酒，濯缨何负白鸥池。眇予亦起沧洲兴，惭愧红尘驷马驰。”(豹，上海人，嘉靖中福州知府。)袁达“次韵”：“高人住得灵山好，坐览晴峰天际奇。簪盍芳筵惊白发，歌迥空谷踏青芝。柔丝牵树连行径，新潦流花入曲池。作客况逢梁苑赋，挂壶何厌鹿车驰。”高世魁“次韵”：“诛茅结屋随吾意，箨帽荷衣岂好奇。窗外晴云长护竹，岩前春雨欲生芝。却惭杜老开花径，愿学山公醉习池。莫许烟霞近成癖，从来肋力怯驱驰。”黄用中《灵山燕集》：“窈窕薜萝丛，嶒一径通。如何蓬岛胜，宛在市尘中。深篠时藏月，高林晚度风。方干有清隐，那更赏心同。”袁表《灵山堂》：“双林别有春，一径向无尘。曲槛花留客，空山月近人。兴随青草洽，歌逐紫芝频。余亦耽奇者，悠然愿卜邻。”林世吉“和”：“地僻攒山胜，门闲避俗喧。烟霞深锁径，松竹静交轩。岩翠寒披席，林香晚扑樽。幽情同恋赏，不畏日黄昏。”陈椿《灵山避暑》：“胜地重来惬赏心，扪萝与客眺层岭。山当睥睨千峰起，路入祗园一径深。古木凌风驱伏暑，悬岩飞霭变秋阴。狂歌不但夸河朔，还有清谈似竹林。”徐熥《夏日灵山堂避暑》：“灌木阴中共倚栏，飞来苍翠落檐端。满林花雨诸天近，六月松风一座寒。鸟入乱云翻影灭，蝉当斜日送声残。相逢正有淹留兴，其奈疎钟报夜阑。”
自开元寺折而东，为宝泉局、福州左卫、三山楼、福州中卫、狮桥、庆城寺、忠懿庙、井楼门街、王胜宅、北斗堂、七穿井、怀北社学、延善庵、贡院、凌云台。
宝泉局 万历五年，奉旨铸钱，以旧兵营及芝山寺余地置局。
三山楼 宋时建。在子城东南，今废。其下为长利桥，俗呼剃刀桥。
福州左卫 宋荐福寺经院地。元时废。至正中，改建勉斋书院。国朝洪武中创为右卫。内经历司、镇抚厅，左、右、中、前、后、中左六千户所俱隶卫。
福州中卫 宋太平寺地。国朝洪武中创为左卫。经历司、镇抚厅，左、右、中、前、后五千户所俱隶卫。
都尉营 在开元寺东直巷内。吴置典船都尉，主谪徒作船于此，今为民居。
狮桥 在寿宁坊之南。
又有经