民人，薄海内外有备无患矣。而以台湾为东南数省藩篱，规制尤宜严密：更班拨戍，赏赉频加；水陆戎军，屯云集鹢。其所以讲习于无事之时、防范于太平之日者，制称盛焉。岂曰山海敉宁，遽谓兵不必备哉！志兵制。
康熙六十年，兵部奏准：『澎湖系台湾咽喉紧要适中之地，移台湾总兵驻澎湖，陆路改设副将』。金门总兵黄英奏言：『澎湖为台湾之门户，今将台湾总兵移改澎湖，台湾设立副将，与水师彼此接应；遥度形势尽善之谋，无大于此』。巡台御史黄叔璥折奏略云：『臣阅地势轻重，澎湖虽称三十六岛居于台、厦之中，究皆一坏之土，错落弹丸。除妈宫、八罩略有人烟，余悉冷落荒屿。原设副将，尽堪防守。兹台湾南北延袤二千余里，村庄、番社、闾井，户口不下百余万。丛山深林，最易藏奸，非总兵不足以资弹压。况安平水师及南、北路副、参各员，与台湾副将职位不相上下，有事势必各怀己见，非如总兵可行调度。今若将总兵设在澎湖与台湾悬隔，往来船只俱候风时；台湾水、陆各营倘有紧急事机，不能朝发夕至。是澎湖固台湾之门户，而台湾实澎湖之腹心，形势重于澎湖，关系沿海各省要害。请将总兵仍设台湾，庶得居重驭轻之道，以造海宇无疆之福』。时水师提督姚堂亦疏陈请，得奉俞允，仍照旧制驻札。
雍正十一年，福建总督郝玉麟等会奏，为敬陈台湾善后事宜等事；经部议覆，奉旨『依议。钦此』钦遵。『查府治为全台心腹，原设兵丁，实在不敷。府治准添设城守一营，参将一员、守备二员、千总二员、把总四员、兵一千名。内将六百七十名分防镇标南、北两路之旧社各汛，更三百三十名留防府库、仓狱等项。其镇标原拨南、北路之大湾等塘兵五十八名，亦改归各路派拨；而镇标三营之兵全数撤回府治，以资弹压。至南路地方广阔、民居稠密，原设各汛不足以资防范，将驻札山猪毛口之守备改为下淡水都司佥书，再添设千总一员、把总二员、兵五百名，合原额设兵共一千五百名。内都司一员、把总一员、兵三百名驻札山猪毛口，堵截生番兼防阿里港等汛；千总一员带兵一百五十名防守万丹。划定淡水溪为界，溪西属千、把汛地，溪东归都司管辖；而都司仍听南路营参将管辖。以参将一员、千总一员、把总一员配兵五百名仍驻凤山县治，守备一员、把总一员配兵二百五十名仍驻凤弹，分防下埤头等处。其千总一员、把总二员、兵二百五十名分汛防守游巡，南路地方得以声援联络。又北路地方番社众多，稽察宜严，官兵分防不足以资防范，参将准其改为副将。再添设都司一员、守备一员、千总四员、把总八员、兵一千二百八十名，合原额设共二千四百名，分为中、左、右三营。以都司为中军，原设守备与添设守备分左、右二营。以左营守备一员、把总二员、兵四百五十名驻札诸罗县治，千总一员带兵一百名分防斗六门等汛，把总一员带兵五十名分防竹脚寮及南北投等处。其笨港、盐水港二汛改归陆路，以千总一员带兵一百五十名分防笨港，把总一员带兵六十名分防盐水港。将原防台协水师兵丁撤回，其海口炮台水汛仍归台协管辖。副将带领千总一员、把总三员、兵五百四十名驻剳彰化县治，以中营都司一员、把总一员带兵二百五十名驻札猫雾捒，千总一员带兵一百名分防蓬山等汛，仍不时在各汛游巡。右营守备千总一员、把总二员、兵五百名与同知同驻竹堑，弹压中港、后垄等处，令各千、把总带兵分防其淡水营。以上俱归上淡水营管辖，照旧拨兵防守。再，安平地方，潮水易长，土松难筑炮台；仿照鹿耳门之式，设立炮架七座，以资捍卫。城内酌量起盖仓廒，贮粟三万石，交与该营收管；每年砻米给兵，以免赴府支领之劳。拨给护卫道员兵二十四名，知府拨兵二十名，台同知拨兵十五名，淡同知拨兵二十四名，台、凤、诸、彰四县各拨兵二十名，并令查缉匪盗、赌博。其拨给兵丁，各拨管队一名管领，听候操演差遣，三月一换。如各兵技勇精熟，该管武员一体拔用；倘有生事不法，即听文员究处。至移驻罗汉门、笨港县丞二员，各给民壮八名；巡检四员，各给民壮四名；县丞移驻万丹，一体拨给。计留民壮四十名，其余裁革。合计道、府、同知、知县、县丞、巡检共革退民壮五百三十六名；除猫雾捒、竹堑两处巡检民壮共一百二十名拨给草地不计外，共节省工食银二千九百二十七两、共米二百一十六石。又，台湾一陆共兵一万二千六百余名，较之内地总兵所辖，官兵既多；而台地幅镇统计水■〈巾肙〉辽阔，澎湖又隔大洋，其总兵若非稍异内地，未足扬威海外。除一切营寨仍照旧例外，应将该总兵照山西、陕西沿边之例，改为挂印总兵，将关防给用方印，以重声威。此台湾营制更定之由也』。
台湾镇标中、左、右三营：挂印总兵官一员，驻札台湾府城内。
中营：中军游击一员、守备一员、千总二员、把总四员、步战守兵九百一十名（内地按班拨戍，饷有定额），驻防台湾府中路口。
左营：游击一员、守备一员、千总二员（内一员，雍正十一年添设）、把总四员（内一员，雍正十一年添设）、步战守兵九百三十名，驻防台