承宣布政使司十三。
京师亦曰北直隶。《会典》：永乐十八年，革北平布政司为直隶。府八：曰顺天、保定、河间、真定、顺德、广平、大名、永平，州二：曰隆庆、保安，属府州十有七，属县一百十有六。而昌平州、通州、易州为三辅，又居庸、倒马、紫荆为内三关，特设重臣于保定以提督之，与蓟州、宣府互为形援，以厚京师之藩卫。隆庆初，改隆庆州曰延庆州。倒马关，在定州西北百二十里，详北直重险。余见前。
南京亦曰南直隶。府十四：曰应天、凤阳、安庆、庐州、淮安、扬州、苏州、松江、常州、镇江、徽州、宁国、池州、太平，州四：曰广德、和州、滁州、徐州，属府州十三，属县九十六。而淮安为漕运通渠，凤阳为陵寝重地，安庆为陪京上游，苏、松为边海襟要，皆特设重臣，申严封守。
山东府六：曰济南、兖州、东昌、青州、登州、莱州，属府州十有五，属县八十有九。分道三：济南道，辖济南府一；东兖道，辖东昌、兖州府二；海右道，辖青、登、莱等府三。又有辽海东宁道，则分辖辽东卫所，而临清、济宁、东平诸州为漕运咽喉，登、莱为辽东应援，皆重地也。
山西府四：曰太原、平阳、大同、潞安，州四：曰汾州、辽州、沁州、泽州，属府州十有六，属县七十有七。分道四：冀宁道，辖太原府一；河东道，辖平阳府一；冀北道，辖大同府一；冀南道，辖潞安府及沁、泽、辽、汾四州。而太原控扼关塞，大同限隔漠南，并为重镇。万历二十三年，升汾州为府。今为府五，州三。
陕西府八：曰西安、凤翔、汉中、平凉、巩昌、临洮、庆阳、延安，属州二十有一，属县九十有四。分道五：关内道，辖西安府一；关西道，辖平凉、凤翔府二；关南道，辖汉中府一；河西道，辖庆阳、延安府二及宁夏卫、宁夏中卫；陇右道，辖巩昌、临洮府二及河、洮、岷、靖四卫、文县一所。又有西宁道，则分辖甘肃、西宁诸卫所。自西安、凤翔、汉中而外，皆逼近边陲，环设重兵，以壮形势。万历十一年，增置长武县，属州。今为县九十有五。
河南府八：曰开封、归德、彰德、卫辉、怀庆、河南、南阳、汝宁，州一：汝州，属府州十有一，属县九十有七。分道四：大梁道，辖开封、归德府二；河南道，辖河南府一、汝州一；汝南道，辖南阳、汝宁府二；河北道，辖彰德、卫辉、怀庆府三。万历初，以上讳，改开封府钧州曰禹州。
浙江府十一：杭州、嘉兴、湖州、严州、绍兴、宁波、台州、温州、金华、衢州、处州，属府州一，属县七十有五。分道五：杭严道，辖杭、严二府；嘉湖道，辖嘉、湖二府；宁绍道，辖宁、绍、台三府；金衢道，辖金、衢二府；温处道，辖温、处二府。而滨海诸郡，控御岛夷，防维特重。
江西府十三：南昌、饶州、广信、南康、九江、建昌、抚州、临江、吉安、瑞州、袁州、赣州、南安，属府州一，属县七十有四。分道五：南昌道，辖南昌、瑞州府二；湖东道，辖广信、建昌、抚州府三；湖西道，辖吉安、临江、袁州府三：九江道，辖饶州、南康、九江府三；岭北道，辖赣州、南安府二。而南、赣接连楚、粤以及闽海，山川深险，奸民易以啸聚，特设重臣于赣州，兼督南、赣、雄、韶、惠、潮、汀、漳、郴、桂诸州郡。而九江控带大江，连接安庆，亦为中流重镇。又隆庆二年，增置定南县；万历三年，置长宁县，俱属赣州府。万历六年，置泸溪县，属建昌府。今县凡七十有七。
湖广府十五：武昌、承天、汉阳、黄州、德安、襄阳、郧阳、荆州、岳州、长沙、常德、衡州、永州、宝庆、辰州，州二：郴州、靖州，属府州十三，属县二百有六。分道七：武昌道，辖武昌、汉阳、黄州府三；荆西道，辖安陆、德安府二；上荆南道，辖荆州、岳州府二及施州诸卫所；下荆南道，辖襄阳、郧阳府二；湖北道，辖常德、辰州府二、靖州一及永顺、保靖二宣慰司；上湖南道，辖衡州、永州府二、郴州一；下湖南道，辖长沙、宝庆府二。而郧阳山川纠结，连接秦、豫，特设重臣于郧阳，兼督荆、襄、汝、邓、商、洛、汉中诸境。又以辰州密迩川、贵，蛮獠纷错，亦设重臣提督辰、沅、靖州以及偏桥、铜仁、思州、播州、酉阳、麻阳、永顺、保靖、施州等境。又万历二十八年，增置天柱县，属靖州。今县一百有七。
四川府八：曰成都、保宁、顺庆、重庆、夔州、叙州、龙安、马湖，州六：曰潼川、嘉定、眉州、雅州、邛州、泸州，属府州十四，属县一百有七。而长官司四，属马湖府；又羁縻军民府四，曰镇雄、东川、乌撒、乌蒙；宣慰司一，曰播州；宣抚司一，曰永宁；安抚司一，曰黎州，所属长官司凡六。分道五：川西道，辖成都、龙安府二及松、潘、叠、溪诸卫所；川北道，辖保宁、顺庆府二及潼川州一；川东道，辖重庆、夔州府二；川南道，辖叙州、马湖府二，又镇雄、东川军民府二，及嘉定、眉、泸、邛四州，播州、永宁等司；上川南道，辖雅州及建昌行都司，黎州、天全等司。而松、茂控扼土番，建昌限制番