隍之祀，始于西汉焉。而南阳王鸿儒则以为周礼八蜡之祭，有水庸之神。庸，城也；水，隍也。此为祀城隍之始。且城复于隍已见于前，则周时已有此祀矣，固不独汉也。自是而后，历代皆有祠祀，惟唐为着。至宋时，或赐封爵、或赐庙额，祠宇遂遍于天下。至有迁就附会，各指一人以为神之姓名，如镇江、庆元、太平、宁国、华亭、芜湖诸郡邑，皆以为纪信、龙沮。江西郡县城隍，率祀汉颍阴侯灌婴；考汉高六年命灌婴下江南，定豫章，或平定之后奉以祀焉，未可知也。至于近世，郡称威灵公、州称显佑侯、县称显佑伯者，则自明洪武三年始也。凡守土官入境，必先祭城隍而后履任；及祈祷水旱，必先牒告而后祷于坛。即祭无祀，亦必前三日牒告；至日，迎城隍神位于坛，以主斯祭焉。今澎湖城隍庙在厅署之东，规模狭隘，不足以展敬，实限于地也。
关帝庙庙在妈宫澳西偏，距厅治五里，日久倾圯。乾隆三十一年，余与协营诸公捐俸增修，祠宇式廓，今焕然一新焉。祀神勇关圣也。元至治时，封义勇武安王。明洪武都金陵，建一十四庙，一曰汉前将军寿亭侯庙，以四孟朔日、岁暮除日，应天府官主祭；又有仲夏太常之祭。祭以少牢。自是香火遍天下，穷乡僻壤皆祀之。嘉靖十年，太常卿黄芳始奏改称汉前将军汉寿亭侯。盖汉寿本封邑，在今犍为；亭侯爵第五等，曰彻侯、曰关内侯、曰县侯、曰乡侯、曰亭侯，是亭侯居第五等之末。今人以侯仕汉，以寿亭侯为封爵非也。本谥壮缪；缪与穆同，用伤武功之不成。今人为碑讳不书谥，亦非也。万历四十二年十月，司礼太监李思始斋九旒冠、玉带、龙袍、祀金牌，敕封为帝，颁知天下。然太常祭祀，则仍旧称。史官焦竑曰：称汉前将军侯，志也。天启元年，太常少卿李宗延有修明祀典疏云：臣于本年正月亲诣本庙，内标三界伏魔大帝神威远镇天尊关圣帝君，冠冕俱系帝服。然本寺职掌初无凭也，此封号所当考核者也。按此，则帝封非朝议矣。及天启四年七月，礼部覆题得旨，祭始称帝。至国朝顺治九年，加封忠义神武之号。乾隆二十五年二月，廷议以原谥壮缪未协，请更定谥号，改谥神勇；岁祀用太牢，典礼与阙里并隆焉。乾隆三十三年三月，奉上谕：『加封忠义、神武、灵佑关圣大帝，其官建祠宇、秩在祀典者，并依新号设立神牌，以申崇奉。钦此』。澎湖自乾隆三年奉文起，每岁三祭，开支钱粮银一十八两。
天后宫庙在妈宫澳，距厅治五里。天后林姓，世居莆之湄洲屿，宋都巡检林愿之第六女也。始生时，地变紫，有祥光异香。长能乘席渡海，乘云游岛屿间。宋雍熙四年二月十九日，升化。是后常衣朱衣，飞翻海上，里人祀之。宣和癸卯，给事中路允迪使高丽，中流震风，七舟俱溺；独路所乘神降于樯，安流以济。使还，奏闻，特赐顺济庙号。绍兴己卯，驾风扫海寇。干道二年，又降于白湖，掘泉饮疫者；累封灵慧昭应崇神夫人。淳熙十一年，加封善利。绍兴间，特封灵惠妃。庆元戊午，以雾遮大溪寇。开禧丙寅，解淮甸围。莆民难食，米船阻于朔风，神反风即至。景定辛酉，海寇肆暴，醉卧廓庑间，神纵火焚之，又令风沙昼晦，跨浅而败；累封助顺、显卫、英烈、协正、善庆等号。元以海漕得神助，赐额灵济。明永乐间，累着灵蹟，命修祠宇，加封号。国朝康熙十九年，封为护国庇民、妙灵昭应、宏仁普济天妃，遣官致祭。二十二年，我师克澎湖，恍有神兵导引；及屯兵妈宫澳，靖海侯施琅谒庙，见神衣半湿，始悟实邀神助。又澳中水泉止可供数百口，是日驻师万余，忽涌甘泉，浥之不竭。施琅上其异，敕建神祠于其原籍湄洲，勒文以纪功德。二十三年，加封天后。六十年台匪窃发，天后显灵，鹿耳门水骤长数尺，舟师扬帆并进。七日，克复全台。雍正四年，巡台御史禅济布奏闻，御赐「神昭海表」之额。十一年，又赐「锡福安澜」匾额于福州南台神祠，并令有江海各省，一体葺祠致祭。乾隆二十二年五月，内阁交出天后封号，奉旨：『原封天后护国庇民、妙灵昭应、宏仁普济、福佑群生，此次加封天后诚孚。钦此』。按天后即妈祖；凡海舟危难，有祷必应，洋中风雨暝晦，夜黑如墨，每于樯中见神灯示佑，亦灵异也哉！澎湖自乾隆四年奉文起，每岁三祭，开支钱粮银十七两。是年五月，前厅周于仁、协镇顾元亮、左营游府柳园共捐俸银三十六两，置买澳民黄明店屋，每月纹广租银六钱五分，交约正高士典等按月收租，以为庙中香灯之费；勒石庙中，以垂永久。
真武庙庙在妈宫澳，距厅治五里。北极真武元天上帝，乃北方元武之神也。元武属水，水色黑，故帝衣服旗帜俱黑；即所谓元冥乘坎而司冬，称冬帝曰黑帝者是也。神为五行之一；五行之祀，载于月令，此天地之正气也。说者谓帝北而位南，南为火，不相克耶？不知民非水火不生活，坎离相济，而人得以养。今南方祝融之墟多祀之者此也。至封神传所称帝为通天教主之弟子，则吾不得而知也。
观音庙庙在妈宫澳，距厅治五里。康熙三十五年，游击薛奎创建。乾隆二十九年重修。祀大慈大悲南海观世音菩萨也。南海，即今宁波郡普陀山是也。山旧为古昌国州地。其所称慈悲者，即吾儒恻懚也。