侯天锡、马应试、余朝宗、杨赓、莫宗文各拥兵立。贼攻梁山，荣贵望风遁。曾英次江口战，败绩，退军五里，至于望江关。贼斫其颊，英杀数人跳而免。
六月，晋赵光远提督四川。光远已降贼，龙文光却守，余众二万人。
秋七月，贼党朱朝臣犯保宁。家居主事郭献珂召故将张成击之杜胜集，大破之；斩朝臣。
八月，命杨鹗总督川、湖等处军务。先是，总督樊一蘅受庄烈帝命，总川、陕军；分巡道马干以贼陷成都，抚按皆死，干遂自为巡抚：然皆不能定贼。乃命大学士王应熊为督师兵部尚书，总督川、广、云、贵军务，赐剑，便宜行事；命兵部侍郎俞思恂、提学道王芝瑞辑兵食，巡道刘鳞左右之。思恂旋卒。
冬，王应熊承制治蜀军；旋言重庆、成都二府小民敲骨吸髓，所供七、八十万并归于贼。佥事张一甲言张献忠自夔门入忠、万，北则李自成逼汉中，广元、昭化以南已降贼；巴、通之际，又为诸贼所掠。时献贼僭号于成都，屠戮郡县无虚日；马科、刘进忠辈分附闯、献，姚、黄贼又布于川西。姚、黄者，汉中土贼姚天动、黄龙长之；赵荣贵擒其党一斗麻代王等，天动等穴蓬州、仪陇、南部间，众数十万，以人为食。久之，分十三家营：袁韬为首，其次呼九思、马潮、王昌、陈林、王友进、王兴、杨正宗、张显、刘惟灵、白蛟龙、杨炳英、李世杰，流劫及保宁，杀戮所及，千里为墟。已更相贰，十三家目多非旧，而作贼如故。酆城、金简间，别有胡明道、姚玉麟等皆作贼；有土暴子者，屠戮不异于贼，民尤畏之。朝廷兵力不能及，惟遵义得完。王应熊、樊一蘅止其地，因以命之。巡按御史米寿图奉命择能任监司者与偕行，亦至。乃发丧，大举传檄讨贼。朱化龙击贼龙鹳山，大破之；追至成都，互战屡月，还守大山关。复以劲卒败贼，复荣经县；俄陷于贼。化龙军小山关，贺珍往来兴、汉之间。
十二月，召杨鹗还；命何腾蛟以原官总督川、陕、云、贵军务，使贾联登为四川总兵官。
宏光元年春正月，贺珍击贼党于广元，败绩。时川北兵数，不能及贼之少半。刘道贞、朱化龙击贼于小山关，大败。道贞攻邛州，不克（详「义旅」）。
二月，贺珍以兵趋汉中，贼党马科拒之；珍不克，科踞保宁如故。曾英取盐于遂宁，以食其军。
三月，王应熊疏：『四川北接郧阳、西次彝陵，南自建昌道云南，东南自遵义道贵州。今贼踞成都，蜀无人迹。闯贼劫保宁、顺庆之民，而为献贼所驱。宜令川陕总督复保宁，臣合黔、滇之力批其虚。广西、郧阳许臣节制，则缓急可以呼应』。从之；以应熊节制云、贵、湖广、广西、郧阳、偏沅巡抚。应熊以曾英兵无律，多劫绅贾；不重其秩。劾马干淫掠；诏逮干，以耿廷箓代。值沙定洲乱，廷箓不果行（详「黔滇之乱」）。何腾蛟亦不克至（详前），干为巡抚如故。
都司杨展自贼中泳出至于嘉定，乘间入犍为，杀伪令；进攻嘉定，遗民开城纳之。其地险阻而近贼，展工抚驭，远近归之。罗徽堡千总廖佐及杨世泰起兵峨嵋，余登皞胜贼于眉州，朱化龙及同知詹天颜复龙安、茂州（详「义旅」）。樊一蘅亦至，乃共起旧将甘良臣为总统，副以侯天锡、马应试、屠龙、余朝宗，凡三万人，攻叙州。杨、屠军干溪，马应试夜济；及旦，展军亦济。贼方败应试军，展断其桥，贼大惊遁；展、应试逐北，生获二千、溺死过半。其酋张化龙遁去，遂入叙州；一蘅犒军江上。贼党冯双礼再攻叙州，陷之。展使苏宝以猓兵击之，自攻其白塔山屯。半济而令：『今日必死战』；尽沉其舟。使张胜、余朝宗攻山左，曹章、郭崇烈攻山右，姚之桢、李朝贵军其后，自当其前。曹章先登，之桢败而更胜；贼大溃遁。苏宝战双礼而败，展以胜军至，又破之；逐北三十里，再复叙州守之。贼党孙可望众又至，一蘅军江上，相持一月；粮尽，退屯蔺州。展军屯江津，贼易杨展，谓『重庆不可失』，使二万贼水陆攻合州，屯于多功城；别以精锐道佛图关，将夹击马干军。曾英、刘麟长救之，使遗民下涪州避贼；使于大海拒水军、张天相阵于陆，戒勿战，自以精卒五百往击多功贼，大败之。即其帜萆山出贼后，大破之亭候。贼怒，坑降卒三千于大仪；英遂屯重庆。贼又截朱化龙及佥事蔡肱明于羊子岭，化龙以蕃骑数百直冲之，贼大溃，尸蔽山谷；别将复败贼于摩泥滴水。又其时范文光在洪县，詹天颜在松潘，权演在广元，谭洪、谭诣、谭文在夔州，皆举城邑奉征调。宣慰使马京、守备杨起泰又大破贼于观川，文光亦使黎武勋击艾能奇走之（详「义旅」）。于是四川之民，大杀贼官；或刺于庭、或付诸水火。凡贼所设守牧令，判死者无算。惟雅州知州王国臣固通贼，至是与下南道胡寅隙，将执寅畀诸贼；寅走，国臣遂降贼。
夏五月，王应熊檄杨展入遵义，及侯天锡、张熊攻永宁，克之；军于鱼腹阙。
秋七月，杨展大破贼梁一训于纳溪，溺死数万。镇安千总周鼎昌被围，贼聚诸舟锁困之；鼎昌断其索，贼大败走。孟乔芳击姚、黄贼，