九月初四日，亲至汀州，督率三省将士，四面堵截，分投剿捕。所获功级，臣与粤、闽省督、抚已先后题报矣。臣念贼虽散亡，然良民尚未复业，余贼尚怀观望，隐忧终在，飞檄广东监军分守岭南道副使洪云蒸、暨镇守广东总兵官邓懋官并驻程乡，严督潮州府县各印官，躬至石窟、松源、蓝坊等处筑围编甲，俾民无渔池之殃，贼无遁迹之所。又虑贼猝兽逸，檄江西分巡岭北道参议祁逢吉遍历各属，查点乡兵，操练军士，耀兵境上。参将汤允文、把总童大胜、金国柱、坐营指挥金之鼎，各统目兵，扼会昌、长宁、羊角等处，专事把截，毋容贼闯入一步，闽兵扼岩前、象洞等处。粤兵分为四路，听令齐进。
崇祯五年十二月初五日，据分守岭南道臣洪云蒸呈称：石窟都为贼所从生之区，兵集而息，兵退而萌，盖该都乃平远与地之半，其人以贼为俗，而程乡之廖坡、蓝坊，亦渐染其俗，并不以贼为讳。其出也有祖饯，其归也必捆载；以其赀纳结强有力者。钱神无所不通，数千之贼立办。本处富民徙居别地，以致良民日消，贼党日盛。故欲贼党之消，必先使良民之盛。然欲良民之盛，必先有定居，以安其身，以固其围，无避贼避兵之患，则筑围之说也。石窟共八围，都司侯服亲督之，十日而围成，户册造完呈报等因。
同日又据该道禀称：此番闽、粤、虔兵七、八千把截各隘，俾贼不得逸一步，而在内清之以保甲，又行之以筑围，又日以宪谕招徕，愿充兵者充兵，愿归农者归农。总之，必于良民中搜出真贼，钤束诛鉏，方有着落。初意筑围毕，诱贼入围，举兵相向，围内良民，缚贼以献。不意围成而贼不敢入，散匿各山。故自十一月初十日起，各将督兵遍搜山菁之贼，即着乡约良民为向导。搜捕十余日，山村将遍，良民帖然为用，贼之就擒者正法。有真贼而入围，必十甲人俱结其无反状，方许入围。后此之教化，刑诛两用，则百年太平可望。此非兵力所及，皆本院玄筹指示也等因。
十二月初六日，又准广东镇臣邓懋官报称：本镇驰至程乡会议搜捕，而石窟寨一带未去。伏莽余孽与龙门流到残党合伙潜藏，夜聚晓散，窃发抢劫。若不乘此兵搜捕，终成滋蔓。十一月初五日，本镇会同岭南监军道副使再四面商，订期十一月初十日四会齐进，申明军令，俱要生擒贼功解献，以凭审验。闽将陈廷对繇岩前象洞一路，粤将张一杰繇梅子入番一路，梁东旭繇大繇一路，侯服繇金沙一路，把总谢定用督潮兵繇松原一路，务期同心协力，除恶安良，以结残局。崇祯五年十一月十二日据游击朱之胤单报：奉令搜捕石窟残贼，督兵生擒贼犯黄大将等一百零二名，斩级四颗。又据福建原任副总兵陈廷对四次单报：生擒贼犯二百十名、妇女九口。惠州参将梁东旭二次单报：生擒贼犯二百二十一名。统兵都司侯服单报：生擒贼犯十名，又招谕向化贼犯三十六名。统兵加衔副总兵张一杰单报：生擒贼犯七十名。石镇营把总谢□□□□□□□十三名。潮州中营（中缺）俱经移解监军。分守岭□□□□□□□□□□据福建分巡漳南道臣顾元镜□□□□□□员山子、松源、蓝坊等处获功之数已陆续具报。兹又于十一月二十三及二十五等日擒获贼八十三名，器械二十一件，牛五十一头。计前后共获过三百八十四功。内有良民，实时审释，而真贼则十居六、七焉。至粤中诸将所获更多，贼党约略已尽等因各到臣。
该臣看得：平远之石窟都向产盗贼，锺凌秀即石窟人也。地方良民既避贼，并避兵，相率远徙亡命，不宄结茅以居，丑类繁多，致程乡之廖陂、蓝坊、松源化为贼随，芟雉蔓延。据父老所传，书策所载，凡六十年一大征，盖亦气运为之也。兹仗皇上神武奋扬，天威赫奕，阁部诸臣密勿赞襄，渊谋指示，暨三省督抚按司道诸臣同心匡济，悉力指麾，用能使百年逋寇，悉就诛夷，遍地贼巢，俱各迅扫。从此闽、粤、虔俱各宿兵善后，道府有司将此地刻刻留心，有奸必察，有抑必伸，有苦必恤，日渐月磨，持之勿懈，行见盗窟化为邹鲁，而强暴皆为善良矣。除有功员役俟粤、闽督、抚题叙外，恐圣明轸念东南，久廑宵旰，先将搜捣情形，从实驰报，伏乞敕下兵部查照，并敕三省诸臣善后抚恤施行等因。崇祯六年二月初一日奉圣旨：据奏残寇略尽，地方宁谧有功员役，着各巡按御史勘明汇叙；其善后事宜，并着该督、抚酌议具奏。该部知道。钦此。钦遵抄出到部，□□到院，备札前来。奉此，仰□□□□□□□□□□事理，即查疏内闽省□□□□□□□□□□□□□叙录，于中有无冒滥，逐一确勘汇详，以凭具题施行等因。蒙此，又奉巡抚邹都御史案验，准兵部咨行司：即便会同该道将善后事宜作速议详，以凭回奏等因。
奉此，又为闽师深入贼穴、擒馘大伙再捷事，据本司经历司呈抄，蒙本院案验，奉都察院勘札，准兵部咨，职方司案呈，奉本部送科抄出福建巡抚邹维琏题前事内称：看得九连山贼，残破走粤，凭岩依洞，引类呼党，日谋蠢动。而南赣抚臣陆问礼、广东岭南道臣洪云蒸恐其良贼混杂，玉石难分，于是悬榜解散之。且又题留闽兵久戍一年以困之。歼渠魁，赦胁从，盖真老成长算哉。