九月丙戌，升四川左布政使司柴经为都察院右副都御史，提督操江。
二十一年二月乙亥，升巡抚应天、右副都御史夏邦谟为南京户部右侍郎。丁丑，改南京刑部尚书周金于南京户部。
三月丙申，改工部尚书顾璘为南京刑部尚书；郧阳都御史喻茂坚总理粮储兼巡抚应天等处地方。
四月辛酉，诏增设松江府青浦县。从巡抚都御史夏邦谟、巡按御史舒汀奏也。
闰五月己卯，巡按直隶御史焦琏以两淮驿传罢敝，奏乞清理。下巡抚都御史王呆及巡按、巡盐御史高懋、胡植会议，将扬州府、徐州愿官当者，仍旧征银；淮安府愿民当者，亦听其便。仍宜查验关文，以禁冒滥。申明旧例，以禁横索。严征钱粮，以济支用。清理夫船，以便递送。兵部复奏。诏悉从之。
九月庚午，督理河道都御史王以旂条陈四事：“漕河仰给山东诸泉水，贵以时疏浚。近已会同各官清查旧泉一百七十八处，复开新泉三十一处，俱入河济运。但恐一失浚浚，寻以湮塞。主事一员，势难遍历，乞分隶各地方守、巡、兵备等官，兼理其事；一、徐、吕二洪为运道咽喉，山石险峻，非水深数尺，莫能行舟。闻旧曾置闸束水。乞于境山镇二洪下，各建石闸，旁留月河，以泄瀑水。沙坊等浅，由河广漫流，更宜筑四坝。武家沟、小河口、石城、匙头湾诸浅，预置方船，以防捞浚；一、漕河两岸，原有南旺、安山、马肠、昭阳四湖，名为水柜，所以汇诸泉济漕河也，被豪强占种，蓄水不多。而昭阳一湖，淤成高地，大非国初设湖初意。乞委官清查，添置闸坝斗门，培筑堤岸，多开沟渠，浚深河底，以复四柜；一、黄河南徙，旧决口俱塞，惟孙继口独存导河，出徐州小浮桥，下徐、吕二洪，此济运道之大者。近巳兴工挑浚。但黄河变迁无常，难保不复淤塞。乞于本口多开一沟，及时疏浚，庶上流有所受，下流有所泄，而二洪常得接济矣。”工部复议：“当从，但以管泉责之有司，事体不一，仍令各部官司之。惟于总理河道官加工部侍郎衔，以便督责。”诏悉如拟。
十月甲申，升张景华为左副都御史，总督漕运兼巡抚凤阳。戊于，操江都御史柴经奏：“南京新江口营，旧以镇江卫官军七百人轮班戍守，今奉旨掣回。请于南京留守及安庆、宣、庐、滁州等卫选舍余补之。其扬州、淮安、九江、安庆等卫、所官军赴镇江操备者，原额二千人，宜仿新江口之例，分春、秋二班，以休其力。”兵部议复。报可。
十二月丁酉，起原任户部尚书王尧封为南京兵部尚书，参赞机务。癸卯，扬州府泰州均摊田地共增粮五千五百六十余石。抚臣上其事，言宜置籍，以示久远。从之。
二十二年八月戊戌，故事，南北直隶决囚，原系刑部编定外号为一籍，用印给各府分贮。每遇秋后，则刑部先期奏请，遣官赴内府领精微批文，以批号比内号底簿。号同，赍诣各地方会同巡按御史审决。二十一年，刑部题遣主事戴楩往北直隶，吴元璧往南直隶江南，吕颙往南直隶江北，楩等各请批文辄行，而失与内号相验。于是，元壁至镇江府，与原给外号验不合，不可以行事。而楩亦称批号与籍号不同，各为巡按御史参劾。刑部复闻，得旨：“精微批号，乃朝廷用防奸伪，关系匪轻。该部关领不审，以致所遣官员不能举正更易，致误决囚大事。所奏，都察院按治以闻。”都察院复：“元璧等宜纳赎还职。”上以元壁等所领舛错，不行奏请举正，而隐蔽如此，令都察院查原差各官，俱调外任。遂调楩顺德府、元壁扬州府、颙河南府，俱通判。
九月戊午，以水灾免应天等府税粮有差。
十月辛巳，诏以直隶扬州府通州原额种马八百五十匹，免其牧养。每匹征银二十两，贮太仆寺市马。
十二月乙酉，以水灾免苏、松、常、镇四府州、县税粮有差。
二十三年三月己亥，户部议：“应天江浦县坍江田地五百余顷，照海门县改折轻则事例征纳，以苏民困。”诏可。
四月丙申，诏南京文武官俸粮，四月折绢，八月折布。
五月壬寅，命南京提督操江、伏羌伯毛汉挂印充总兵官，提督漕运，镇守淮安地方。刑都、都察院复：“刑科给事中罗崇奎奏，每岁五六月间，笞罪应释放，徒杖应减等发落者，宜加钦恤；枷号例亦暂蠲免，至六月终止。南京法司并如之。”报可。
七月丙午，周用兼右都御史，总督漕运，兼巡抚凤阳。
八月癸未，诏起原任刑部尚书唐龙为南京刑部尚书。戊子，升南京右通政欧阳塾为南京应天府府尹。己丑，户部言：“江南灾甚，请以南京应天十一府、州今年兑米百四十七万石内，除三分征银解纳，其余米一百零三万二千有奇，于内量准十五万石临、德二仓支运，每石折贴脚价银一钱五分。余八十八万二千余石，照旧征运本色。其南京长安等四门并各卫仓粮，无论本折，俱每石征银五钱。再将前项各衙门派剩米折