丙申，洪承畴率曹变蚊、白广恩、吴三桂等至宁远。承畴驰松山，度兵将寡不足守御，乃调宣府大同王朴、杨国柱、蓟镇唐通、榆林马科抽练兵共七万。
清兵自义州大举入塞，祖大寿合诸军于锦州，斩三十六级；明日再战，清兵引退。
辛丑，逮抚治郧阳右佥都御史袁继咸。
是春，招安内丘西山寇。
夏四月丙午朔，立故都督刘綎祠。
刑部主事雷演祚论故督师杨嗣昌六罪可斩：曰失藩封、陷郡县、参抚臣以逭咎、诵梵咒以销贼——至张献忠入川单裤踪逃、贿题监军、交结朋党；不报。迨夏，上悯嗣昌尽瘁，谕祭一坛。
壬子，蠲安庆崇祯十年以上逋租，以后半之。
清兵自塞回宁远、锦州；东关副总兵那木气、都司桑永顺故西人，遂归降于清。东关陷，清兵益攻锦州，掘堑垒墙为久攻计。祖大寿拒守四月余，时出巷战，仍复东关；洪承畴进至松、杏。
张献忠攻应山，知县章日煇御却之。
甲子，以丁启睿为兵部尚书督师，赐尚方剑，节制陕西、河南、四川、湖广、江北，仍兼督三边军务；陈新甲荐之也。
张献忠陷随州，杀知州徐世淳。
辛未，命刑部删正「律例」进览。
甲戌，命成国公朱纯臣、新乐侯刘文炳、礼部尚书林欲楫同浙江提学副使王应华相视皇陵——应华善形家言，林欲楫荐之，故有是命。
开封大疫。
五月乙亥朔，崇明盗顾荣犯太仓；寻遁。
庚辰，大学士范复粹致仕。
壬辰，召陈新甲于中极殿。时祖大寿围于锦州五阅月，声援断绝；有一卒间出，兵云：『城内粟足支半年，第乏薪耳』。并传大寿语：『宜车营逼之，毋轻战』！洪承畴集兵数万，待援未决。上忧之，问新甲「计安出」？新甲求退，与阁臣及侍郎吴甡、总督傅宗龙酌议：『请遣司官面商于承畴，有十可忧、十可议；祈皇上察报』！从之；遂命职方郎中张若麒往。
是月，寇陷信阳。
六月乙巳朔，户部请设漕运总督；乃以史可法为户部右侍郎兼右佥都御史，总督漕运兼巡抚凤、泗、淮、扬。
陈新甲奏陈边事，欲出兵塔山，趋大胜堡攻营之西北；出□杏山，抄锦昌，攻其北；出兵松山，渡小凌河，攻其东；又正兵出松山，攻其南。命下行营议之：『承畴统正兵，仅白广恩、马科、吴三桂敢战；若分三将于三路，虑众寡不敌。且兵既分，则势更弱』。承畴请且战且守，略曰：『久持松、杏，转运锦州，守御颇坚，未易撼动。若清再越今秋，不但清穷，即鲜亦穷矣：此可守而后可战之策也。今本兵议战，安敢迁延！但恐转运为艰，鞭长莫及。国体攸关，不若稍待，使彼自困之为得也』。上是之，而新甲执前议。职方郎中张若麒躁率喜事，见前战松山、石门皆有斩级，谓「围可立解」，上密奏；命留关外料理。新甲又贻书于承畴曰：『近接三协之报，云又欲入塞；果尔，则内外受困，势莫可支！门下出关用师年余，费饷数十万；而锦围未解、内地又困，何以副圣明而谢朝中文武诸人之望乎』！承畴内激新甲言，又奉密敕，刻期进兵。新甲荐前绥德知县马绍愉为兵部职方主事，出关赞画；若麒、绍愉并谓兵可战，遂不用承畴策。
先以薛国观事，词连刑部右侍郎蔡奕琛；命逮至。至是，于系所上言：『去夏六月，有同邑诸生倪襄者，语知县丁煌述庶吉士张溥言臣旦夕必被逮；未几，而王陛彦果劾臣。里居庶常，结党招权，阴握黜陟之柄』。遂征丁煌诣京指证，下倪襄于狱讯之。既而奕琛又劾张溥，并及故礼部右侍郎钱谦益；上又命溥、谦益奏。
癸酉，两京、山东、河南、浙江旱，蝗；多饥盗。
是月，张献忠、李自成相构，罗汝才亦忤献忠；献忠奔郧西，自成、汝才分兵下东南。
秋七月戊寅，临清运河涸。
张献忠陷郧阳。
甲申，蠲霍丘逋租。
丙戌，上御经筵；念锦州事，问「兵部近日何无边报」？且曰：『此举得解围，固为胜算；但兵未离险，朕甚忧之』！
丁亥，召赐正一嗣教大真人张应京于会极门。时北京甚疫，死亡昼夜相继，阖城惊悼；故有是召。
戊戌，宴衍圣公孔胤直、五经博士孟闻玉。
蠲襄阳逋租。
庚子，洪承畴誓师援锦州。时兵部职方主事马绍愉练兵车以待战；壬寅，抵松山，夜见清兵屯乳峰山东，承畴兵登乳峰山西。乳峰距锦州五、六里，炮石相应。又东西石门并进，兵以分势，遂立车营，环以木城；部署略定，清兵大骇。初，西人、辽人脱归，云今秋不得锦州，粮且尽，议撤兵归；故承畴欲待之。而陈新甲信张若麒、马绍愉言，再趋战；承畴遂进师。乙巳，合战，战甚力；斩百三十级，获王子及孤山牛鹿，杀二十余人。阳和总兵官杨国柱阵殁，李辅明代统其兵。祖大寿分步卒三道，欲突围出；兵围三匝，克其二，望外援犹隔，不得达。
八月甲辰朔，吏部奏言：『漕运总督，宜重臣驻节淮上；当以史可法总督漕运、巡抚凤阳，朱大典提督凤阳等处军饷』。报可。
辛亥