因屡次奋勇，已赏给同知职衔；今又招集生番、听候调遣，着福康安即将曾中立酌量补以实缺。其余义民刘绳祖、郑天球、张元懃、蓝应举等，并着福康安查明如何加恩，或补以实缺、或加赏职衔之处？分别具奏，以示奖励。至前在下埤头一带剿贼之义民首郑其仁遇贼阵亡；郑其仁前已赏给守备职衔，着交部加一等照都司职衔议恤。该义民家属，并着福康安从优赏给养赡』。
又谕曰：『鄂辉、普尔普此次均属奋勉，着加恩赏戴双眼花翎』。
谕军机大臣等：『此次官兵、义民分投搜捕，将贼目庄大田擒获；其首先擒拏者，究属何人？着福康安查明，据实具奏。现在大兵告竣，台湾地方一交三月，气候即已炎热；屯练兵丁素不耐热，计此旨到时已属三月下旬，即应早行撤回。着传谕鄂辉，即令原带屯练之总兵将官率领屯练等先行内波，取道回川；鄂辉亦即由驿来京陛见。其巴图鲁侍卫章京等，即令海兰察、普尔普等仍分起带领回京。至此外应撤各兵，着福康安遵照节降谕旨，次第令其渡回内地，各归营伍。此时台湾全郡平定，其余零星逆匪陆续搜查，计三月内自可全竣。但应办善后事宜，最为紧要；常青现已革职，毋庸交办。着福康安与徐嗣曾悉心筹酌，将改建城垣、清厘地亩、添设官弁等事妥为经理，务期一劳永逸，绥靖海疆；且不必急于来京赡觐，务将善后一切事宜料理妥协，于八月万寿节前到热河赡觐亦不为迟。且福康安此次凯旋内渡，非如前此进剿时关系紧急，不得不冒险遄行者可比，亦应候风色平稳方可渡洋，勿冒险轻涉；并内渡各省将弁兵丁，均不可令其冒险，以副朕体恤眷念至意』。
二十八日（辛酉），谕〔军机大臣等〕：『现在台湾全郡平定，大功告蒇；一切善后事宜，最关紧要。李侍尧现驻厦门照料撤回官兵内渡及核办军需各款项，事务繁多；自未能前渡台湾，会同筹办。昨已有旨令福康安同徐嗣曾悉心筹酌，将改建城垣、清厘地界、添设官弁等事妥协经理。徐嗣曾系福康安奏请帮办之人，且系本地巡抚；一切事宜有福康安在彼会同商办，自能斟酌妥善，一劳永逸。至李侍尧系该省总督，如有应行会办之处，原可彼此札商，熟筹妥办。再，台湾逆匪滋事一案，前因柴大纪在总兵任内骫法营私、废弛激变，福康安并未将其种种劣款指出参奏，李侍尧、常青亦并未据实直陈；是以将福康安严饬、李侍尧交部严加议处、常青即予罢斥，并将前任督臣富勒浑、雅德革职拏问、俟解到时并按律治罪。至徐嗣曾身任巡抚，台湾营伍虽非所辖，但伊在闽年久，于柴大纪纵令兵丁私回内地贸易牟利及废弛营伍不加训练，种种酿变贻误之处，平日岂无闻见！乃竟视同膜外、缄默不言，将来自有应得之咎；并着徐嗣曾明白回奏。又，台湾道永福在府城率领兵民协同防守虽有微劳，但该处地方官平日贪黩敛怨、酿成事端，皆系永福所属；已不得为无罪。且柴大纪近在同城，种种贪劣不职，如永福曾经揭报督、抚而督、抚置之不办，应令据实指出，自当专治督、抚以徇隐之罪；若永福并未揭报，则不得因其有守城微劳稍为宽贷。倘伊平日亦有营私之处，则更不必言矣。着福康安即向永福切实讯问，据实覆奏；务使功罪两不相揜，以昭平允。至杨廷理原系同知，各州县非其专管，于此案尚无大过；且伊在府城带领义民等悉力守御，一得官兵打仗杀贼信息，即随时禀报李侍尧，尚为迅速。着福康安查明杨廷理如才具尚属可用，即据实保奏，候朕酌量加恩录用』。
二十九日（壬戌），谕曰：『柴大纪在任四年之内，已婪索金银五、六万之多；且因台湾逆匪滋事，豫行寄信家中，嘱伊子先行防备。现据琅玕在其屋后地平之下，起出金锭银两。可见柴大纪居心狡诈、任意贪黩，若非私令兵丁渡回内地贸易牟利并勒索所属、剥削兵民，焉能拥有厚赀；是柴大纪骫法营私、贪婪激变，种种款迹已确凿可据。柴大纪业经革职拏问，应俟解到后交部照律定拟，明正其罪。向来朕办理庶务，一秉大公至正；赏功罚罪尤务严明，从无成见。如柴大纪在嘉义县时被围紧急，曾谕令不妨保护义民，全师而出。柴大纪覆奏：不忍将数万生灵委之贼手，仍督率兵民忍饥固守。朕以其甚有良心，览奏为之堕泪；是以即加封伯爵、赏给银两。而其种种贪劣捏饰之处，彼时尚未有人摘发；所谓「君子可欺以其方」者此也。迨柴大纪在任各劣迹节次败露，前经福康安奏其为人狡诈不可信；福康安方抵该处，自未知其实在劣款，必因人言籍籍，故为此奏。后因德成复命，朕询出前情；节经谕查询，始据李侍尧遵旨逐款查明属实、陆续参奏，因即降旨将柴大纪革职拏问。可见朕于臣下功罪，惟视其人之自取；有功即赏、有过即罚，从不稍存适莫之见：此天下后世所可共喻者。是以得邀上天眷佑，五十三年以来屡集大勋、开疆拓土，未必不由此敬天勤民之念有以启之也』。
闽浙总督李侍尧奏：『台湾军兴以来，拨运浙江、江西、江苏、湖北、湖南、四川等省米石；嗣因台州等九帮漕米冻阻，复奉旨就近运闽备拨。今军务业经告竣，无须多为筹备。除台州等帮漕米现已飞咨停运，其各省拨运米除陆续运