为正总统、张应元副之，率军趋绵州，分屯要害。元吉自间道走射洪，遏蓬溪以待贼。贼方屯安岳之周里场，谍知官军且至，宵遁。官军遏其归路，贼转掠什邡、绵竹、安县、德阳、金堂间，所至空城遁。
十二月，献忠陷泸州。泸州三隅皆形锐而面江，惟立石站一路可北走。贼既走绝地，元吉谋以大兵自南捣其老巢，伏兵旁塞玉蟾寺，蹙贼北窜永川，逆而击之。而永川令戴尧云者先期遁，向导无人；元吉按行城中，惟丞、簿一、二人。贼渡南溪，陕军纵之；遂越成都，走汉川、德阳，入巴州。
十四年（辛巳、一六四一）正月，嗣昌自统舟师赴云阳，檄三军陆行追贼。元吉虑贼或东突，劝嗣昌分军出梓潼扼归路；不听。既诸将从泸州蹑贼后，贼果折而东反，归路尽空，不可复遏。自巴抵达及于新、开，官军追及开县之黄陵城，日晡雨作，诸将请以诘朝战；参将刘士杰奋曰：『吾四旬逐贼，今乃及之，纵使佚去，吾不能也』。擐甲持矛曰：『大丈夫独取献忠耳』！猛如虎鼓其众并进。士杰所当摧陷，贼大披靡。献忠登高望我师，见无陕兵旗帜，而左兵亦携沮不前，士杰孤军跳荡，后无继者；乃密抽壮骑潜箐谷中，乘高大呼驰下。左兵先溃，士杰及游击郭开、如虎之子猛先捷皆战死。前兵既覆，如虎率牙兵苦战；中军马智挟如虎溃围出，旗纛军符尽失。嗣昌在云阳闻败，谋归楚，顾根本；传箭召溃兵顺流东下。贼已席卷出川西，烧新、开驿置，楚、蜀消息中断；贼大队已至当阳，而襄阳未之知也。
初，献忠之败于玛瑙山也，良玉擒献忠妻敖氏、高氏及徐以显、潘独鳌送襄阳狱。独鳌诡姓名黄冈刘若愚，愿见督师言事，称：『难生有治平天下之略，不幸陷贼，今自归』。嗣昌诘之曰：『尔才学为张献忠用尽，尚有遗余为朝廷用邪？且献忠不识字，尔草飞檄以逆天骂国，死有余罪』！始俛首。随行书吏尹曰凤谓：宜早杀之』。嗣昌不可。乃并前所执敖氏之兄及养子惠二者同系襄阳狱。知府王承曾年少佻易，每晚囚簿呼名，悦敖氏、高氏之艳，托以问贼中事，笑语颇洽。狱吏多与贼通者，独鳌等得以脱桎梏，防御颇疏。嗣昌以献忠飘忽，尝移文为戒；承曾笑曰：『是讵能飞至邪』？献忠既败官军于开县，即东走；留罗汝才拒郧抚袁继咸兵，自率轻骑一日夜驰三、四百里，杀督师使者于道，取军符，遣刘兴秀等二十八骑伪为官军，持符验夜叩襄阳城。巡道张克俭纳之，处其人于承天寺。夜半火起，襄阳府端礼门亦火，贼队疾驰至，城中大乱；独鳌毁狴户，偕敖氏、高氏以出。昧爽，贼尽入城。承曾突围走，克俭及署知县事李大觉、推官邝曰广、游击黎民安（考曰：据「庐州忠义传」补）死之。献忠缚襄王翊铭坐堂下，属之酒曰：『吾欲断杨嗣昌头，今借王头，使嗣昌以陷藩伏法；王其努力尽此酒』。遂杀之，投尸火中。福清王常澄逃免；潜觅翊铭尸，拾颅数寸以归。贵阳王常法并宫眷俱遇害。时二月初六日庚戌也（考曰：「北略」、「纪事本末」谓：『襄阳陷，贼发银十五万以赈饥民。襄阳守兵数千，军资器械山积，尽为贼有』。「绥寇纪略」则云：『献忠以全队未至，惧良玉之诣其后也，张伯鲸饷银数十万在城中，不及问，居两日即去』。未知孰是？姑两存之）。初九日癸丑渡江，破樊城。十五日己未，陷当阳、郏县。二十一日乙丑，陷光州、新野。嗣昌行抵荆州之沙市徐家园，惭惧自杀。献忠复合汝才之兵东下，破光州、北城，残商城、罗山、息县、信阳；闻官军在蕲州，乃烧固始、西关，分兵犯茶山、应城。四月二十五日，陷随州，知州徐世淳巷战，陷胸穴股以死；其子肇梁亦死，两妾及婢仆死者二十人。贼破信阳，获左良玉旗帜，假之以趋泌阳。六月初六日夜大雨，乘以入，知县王士昌不屈死。围唐县，再攻应山；应山之民工射猎、毒弓矢，傅人肉沸烂，故贼再攻不克。七月，献忠围郧阳，王光恩御之，多杀伤，献忠遁走。会总兵黄得功麾下叛兵投之，贼大振；拔郧西，群盗蚁附以万计，东掠地至信阳。
献忠素惮左良玉，既屡胜而骄，则谓良玉为不足畏。诸将妻拏之在襄阳者，献忠又尽戕之；故良玉军距跃思斗。八月，良玉从南阳进兵，追及之于信阳，大战，斩其头领沙某，夺马万余匹，降其众数万。献忠射伤股，乘夜东奔。郢抚邀其前，良玉将马进忠蹑其后；过龙冈、苏家坂、免儿沟、五股泉四遇，皆大斩获。献忠负创不能驰，保其妇女小子，日行数十里。良玉自郧北发追之，贼已入掌握；而自兴安转馈信阳百二十里，大雨五日夜，江涨道绝，将吏首尾离置数十处。献忠走而免；官军四面蹙之。罗汝才既与献忠不合，走别道诣李自成；献忠前驱入哨，又为自成所邀取。谍者谓：『献忠矢贯胫已毙』；诇之，乃在商、固山中。先是，革、左五营窜英、霍间，将越险隘合献忠。献忠亦以奔败而思与之通也，九月，出商城之牛市畋，取道向英山。监军孔贞训、副将王允成大破之于望云塞，献忠众散且尽，乃因汝才以奔自成。当襄阳之陷，献忠自诩威名出自成右；及军败往归，所从不过数十骑，自成欲以部曲遇之，献忠不肯屈。自成将杀之，汝才止之；资以五百骑，麾曰：『