等宣遗命，以其弟郑世袭护理大将军印。未几，马信、黄安皆物故，世袭以黄昭、萧拱宸为腹心，拔刘国轩管镇事，谋自立。报至思明州，郑泰、洪旭、黄廷、工官冯澄世、参军蔡鸣雷等皆不从，立郑经为嗣，称世子，发丧即位。
时靖南王耿继茂移镇福建，与总督李率泰遣中军王明、赏功李有功至思明州议抚，郑泰等议照朝鲜例冠带不薙发复耿、李，使疏请，而泰遣中军官杨来嘉同入京待命；后不报，释杨来嘉回。
八月，京中差户部郎中贲岱、兵部郎中金世德入闽安城招抚。凡海中文武官投诚者，依例照品级升降补用。
十月，洪旭、郑泰等以兵千余人配船，送郑世子入台湾。郑经以周全斌为五军，冯锡范为侍卫（澄世之子），陈永华为咨议参军。至澎湖，其将李思忠船飘至台湾，知诸将有谋，逃回；郑经随即防御，因乘风入鹿耳门登岸。全斌令连夜伐木为寨扎营。次早，黄昭、萧拱宸谋奉世袭拒经，值大雾，昼瞑，咫尺不相见，诸将多迷误失期。惟黄昭兵先至，攻其前。黄昭攀木而登，为流矢所中，堕下。全斌令斩其首，大呼示众，军士皆迎降。大雾忽晴，日已晌午。锺宇等至，皆反戈而迎。郑经入安平镇，请世袭至，待之如初。世袭委罪于其仆蔡云，云自缢；郑经收萧拱宸、李应清、曹从龙等斩之，余皆不问。诸将营兵，拨守汛地如故。
十一月，郑经率周全斌等同其叔世袭回思明州。后世袭入京归命，授精奇尼哈番；颜夫人、郑芝豹自戍所发回，准在京同住。
癸卯（康熙二年）
正月，郑经驻思明州。时洪旭守思明州，郑泰守金门，黄廷守铜山。郑经得郑泰与黄昭往来书，欲袭取之，郑泰不自安，称病不出。
张煌言党伪靖波将军阮英率文武各官，诣温州投诚；浙督赵廷臣以闻。
三月，郑经命周全斌船入海澄港取粮，欲袭金门，见有备，乃止。
四月，参将陈永华谋以郑经将回东宁而请郑泰为居守户官，统辖诸镇，资其饷给兵，铸「居守户官」印，遭协理吴慎赍至金门。泰遣其弟鸣骏入谢，郑经慰谕之。见陈永华，与鸣骏情好甚密。鸣骏回，永华力劝其行，泰遂于六月初六日带兵船并饷银十万至思明州。是晚，入城赴席，郑经以其前通书黄昭，面质之，遂交与洪旭监留。周全斌率兵并其船，独蔡璋一船得脱。天未明，至金门，鸣骏仓猝与泰之子缵绪率诸将及兵丁眷口下船，入泉州港，向总督李率泰投诚；船凡二百余号，兵八千余。全斌等追之不及。后京中封鸣骏为导义侯，缵绪为慕恩伯，文武官吏班赏叙用有差。
初十日，郑泰见其子弟家眷兵众皆入泉州港，遂自缢而死。
七月，郑经以黄而辉为思明州知州，黄廷之子也。
苏利反叛。二十七日，朝命兵部侍郎硕图、郎中沙海、正黄旗副都统木克必兔、刑部郎中希福往广东征苏利。广东总督卢崇俊奏报：『八月十二日，兵至南塘，苏利亲领万众迎敌。平南王尚可喜合兵击之，贼始溃散。将军提督督阵，贼尸满野，官兵驰围碣石，贼夜开门潜遁，我兵抢门而入，提督兵丁李起鸿阵斩苏利，验明尸首，投诚员役认项有疙疸是实，臣捐银三百两、马一匹、袍帽缎疋赏之，以示鼓励。苏利家口，先期出城下海遯去』。
黄廷自铜山入见，郑经慰谕之。
海中自郑鸣骏入泉州，人心解体，镇将多叛。右武卫杨富、左武卫何义、精忠伯陈辉等，文官参军蔡鸣雷、礼官都军陈彭等，皆先后投诚。
九月，荷兰国王纠集甲板船十六只，番兵数千，会靖南王耿继茂、总督李率泰，约共攻两岛，候事定之日，欲求浯屿筑城贸易，如广东香山澳例（后准纳贡互市）。李率泰遂议平岛。
十月，调齐水陆官兵。陆路提督马得功督郑鸣骏以船数百号出泉州港，水师提督施琅同海澄公黄梧出海澄港，靖南王耿继茂同荷兰国王扎营于同安港之刘五店。至期下船渡海。守高崎正兵镇陈升先约降。
尚可喜奏：『十月二十二日，蛋贼李荣、周玉称奉永历勒印，号「恢粤将军」，直犯广东省城。臣随同抚、提二臣，调令现在船只，前往击贼。周、李二贼，扬帆遁走，炮船追袭八十里，至鱼珠缆尾海面，贼援已至，与兵船对敌。地多沙浅，贼乘上风顺水，烧哨船三、炮船十及水师舟一。暮夜收兵。二十三、四日，贼船东西抢掠。二十五日。贼攻顺德县南门，捆知县王允下船。贼悬张伪示，沿海乡村，为其造船。二十八日，臣据镇臣张国勋报，会同密遣摆牙喇参领刘国保统马步兵一千，协镇将军标下甲兵五十，提督甲兵五十八，擒烧村寨船只。臣密谕镇臣张国勋、班际盛统领战船，水陆并进。T十日，周、李二贼率船一百二十三迎敌，镇臣张国勋、参领刘文焕两镇，各营游击薛成虎等，提标游击苗英等，统领头敌船，直前冲杀。左翼镇臣班际盛、协镇将军王运昌、水师游击张友才、参将刘光宗、提督守备文自炳等，统二敌战船抄出夹攻。自午至申，飞跳贼船，擒斩贼众，抛掷火罐，焚烧贼