衡州门户，相距仅百余里，三桂所必争，乃遣马宝等悉锐环攻，昼夜不息；至八月，城垂陷，而三桂暴卒。诸将解围赴衡州，聚谋迎其孙世璠于云南立之。初，十四年陕、甘之变，四方骚乱，圣祖欲亲征，驻跸荆州，就近调度；而廷臣以为京师根本重地，车驾远出，恐有讹言奸宄窃发，固请毋行。及三桂僭号，圣祖慨军旷日持久，复下亲征之令。廷臣又以贼势日蹙，无劳远出为请，帝未决，会三桂死，乃止。
三路入滇世璠既立，不敢留衡州，退居贵阳，恃川、湖、广西为屏蔽。然自三桂殁，部下失措，无能定战守之策者，官军势益振。于是湖南则安亲主，广西则传宏烈、莽依图、赖塔，四川则平凉提督王进宝、陕西提督赵良栋皆累战累捷。十八年（一六七九年）正月，吴应麒自岳州走常德，寻复弃城遁，长沙、衡州相继下。同时，宏烈等亦克桂林，走世琮。而王屏藩守汉中，以饷运不继，又为王进宝所迫，退守保宁；翌年（一六八○年）正月，遂自杀。良栋亦以是月克成都，三省略定。是年三月，诏安亲主率所部大军之半凯旋，而以贝子彰泰代之。三道之师合趋云、贵，即彰泰以平定湖南之师，自沅州出其东；赖塔以闽、粤之师，自南宁出其南；而良栋以川师出其北。十月，湖南官军由平越趋贵阳，世璠偕诸将走云南，官军乘胜西进。翌二十年（一六八一年）正月，与赖塔军会于曲靖。二月，抵云南；世璠据五华山宫城，誓死守御，累月不下。至九月，良栋已尽逐川南诸寇，进与湘、粤之军合国，攻益力，以十月克之。世璠自杀，马宝等为俘，寻磔于市，云、贵悉平，班师。于是，康熙十二、三年以来蔓延十省之大乱，全归镇定，而台湾郑氏之独立遂不旋踵而覆矣。
尚之信之伏诛尚之信既降，复怀两端，官军征湖南时，趣之出援不赴；比永兴危急，又坐视不救。三桂死，始听调遣，从征广西，驻军武宣。会其弟之孝谋袭藩位，令藩下人张士选赴京告之信心怀怨望，放言讪上。都统王国栋者，故之信私人；至是亦助之孝，发其罪状。十九年三月，诏侍郎宜昌阿等驰往按问。之信闻命，自武宣还广州，上疏抗辩，诏令至京对簿。而藩下总兵李天植怒国栋谗构，诱杀之。事闻，天植坐谋反伏诛。之信遂以是年八月赐死，之孝并坐褫职。
耿精忠之伏诛耿精忠之降也，以请剿海贼立功赎罪为词，康亲王杰书奏复其爵及所属官职如旧。朝廷乃以耿昭忠（精忠弟）为镇平将军，驻守福州，而使精忠率所部从征；旋收复兴化、泉州、漳州，遂郑锦入台湾，移师征潮州。会尚之信以广州反正，潮州之刘进忠亦降，精忠遂驻守其地。十六年四月，康亲王议令将军赖塔守潮，而撤精忠还福州。圣祖虑其疑惧生变，诏勿撤。十一月，藩下参领徐鸿弼等遣人赴部，首精忠归顺后尚蓄逆谋，列罪状五款。同时昭忠亦以鸿弼首词，具疏入告。圣祖留疏不发。十七年春，召昭忠还京，仍命精忠还驻福州，而密谕康亲王令之自请入觐。十九年八月，精忠入朝，以藩兵授所属都统马九玉辖之。圣祖乃以前此留中诸疏下法司勘问，部议黜爵磔死。然圣祖以九玉尚握兵柄，不欲遽发，命系精忠，待鸿弼等至京对簿。明年十月，大兵平云南，九玉亦解任归旗。于是台官交章言三桂宜戮尸，精忠及其党应按律议磔，而大学士明珠亦极言精忠罪在不赦；乃诏析三桂骸骨颁示海内，而磔死精忠于市。
封建潘镇之全废三藩既平，朝廷尽籍藩产入官，充军饷，撤藩兵回京师，而于福州、广州、荆州等处各设八旗兵驻防。自是不复以兵权土地世予臣下，凡亲贵功臣毕留京师，宗室自亲王以下至奉恩将军，爵凡九等，有俸、有庄田。功臣自一等公以下，至恩骑尉，爵凡二十六等。虽世袭有差，实际上无几微之权势。由是前代封建之弊绝。其任全国之守备者，则各省有提督、总兵等官，以统绿旗；各要地有将军、都统等官，以统驻防八旗，然皆掌兵柄而不擅财赋，且与文臣互牵制焉。由是前代藩镇之弊亦绝。中央集权之制，至是渐完密矣。
六、台湾之收服
郑氏占领以前台湾之历史台湾自郑氏占领以前，为马来种生番所据，未尝受中国之统治。隋大业中，虎贲将陈棱尝一至彭湖，东向望洋而返。「宋史」谓彭湖东有毘舍那国，即其地也。元置巡司于彭湖，明初废之。天启二年（一六二二年），和兰人既据南洋诸岛为贸易地，欲求商港于中国，乃以十七艘之舰队谋犯澳门。时澳门已为葡萄牙人极东贸易之要地，当兰人来侵，中国兵与蒲人协力拒之。兰人不得志，退入彭湖（西名Ｐescadores，蒲语渔夫之义也），筑城居焉。寻又为明军所逐，土人复起攻之，乃以天启四年（一六二四年）退据台湾（西名Formosa，亦出蒲语，译言美丽）。自是以来，兰人次第开拓，先筑安平城（FortZealaudia），旋筑赤嵌城（FortProvintia），又遂西班牙人于岛外，台湾全土归其掌握。乃改革行政，宏布宗教，授土人以兰语，成绩颇着；而是时中国大陆兵乱渐起，避难来住者日以繁衍。于是中、兰两国之移民势力相敌，而郑成功终以战胜之结果，据有其