移动内外狮头社矣。于是刺桐脚一路进至大桥头，章高元以亲兵副营驻守；南势湖一路进至衡山，余光德以武毅右军左营驻守，各距内外狮头等社不过数里。其山径适中处所，则分哨联驻，以防抄袭。而山中砖石均缺，诸营步步逼扎，则挈麻布囊袋以趋，得险即守，实土立壁，须臾而就。逆番为之气夺，然犹负隅不下，垒石为墙，遍插鹿角于外，而建哨台哨旗于中，以壮声势。间出二、三百人，分途伏伺，放枪迎击。我军亦不敢凭众前犯矣。
先是淮军东渡以来，值秋霖湿热交乘，瘴疠时作，而海风暴迎，稍觉中寒，即病不能兴。至于春初，员弁勇夫后先陨命凡七百余人。唐定奎始为医药拊循，继为成敛合葬，乞沈葆桢请恤于朝如典。未几，张光亮殁于营，田勤生代领其众。王德成又以病殁。二人皆淮军百战旧将，唐定奎所深倚者，恸之如失左右手。于是简选精锐，更易将领，以捣巢擒渠励，众用命。夏四月十六日，唐定奎自督亲兵正营进剿内狮头社，以左军左营陈有元为左翼，右军右营宋先聘为右翼，而别将毕长和率队伏山后以断龟纹社逆援，田勤生督右军正营继之。又以左军右营何迪华扼山冈，以断外狮头社往来之冲。部署既定，乘曙衔枚而入，逆番迎拒中路，炮动肉飞，而左右翼各已踰岭而前。逆番惊扰，遂乘锐猛攻，合捣其巢。番逆犹负险死守，以待龟纹社外援。随为毕长和伏队所破。于是田勤生等分兵由山后遶出，合围三时，将内狮头番社攻破，斩获三百余名，余窜龟纹社而去。适周志本亦已攻破外狮头社，驰使献捷。
先是余光德驻营衡山时，中军前营副将刘朝林别营狮头山背，逆番时来争战，互有伤亡。唐定奎既定进剿内狮头社，周志本承檄并起，以刘朝林从已当中路，而梁善明居左，余光德暨右军左营姚天霖居右。各督所部，并力进攻，斩杀数十人。逆番遂弃社寨往大甘仔力社奔逸。唐定奎乃檄诸将分营驻守，以防逆番侵劫，而巡察溪壑间白骨甚多，乡兵指为王开俊所部阵亡处也。其后竟得开俊尸于社左密林，悬竿中，面目尚如生云。
始开俊进剿失利，唐定奎以为抚番开山为海防自强要图。开俊此失，深于抚局有妨。如逆番授首，诸社输诚，乃台湾全局之幸。及进兵入山，檄凤山知县孙继祖随营相机办抚，而先期晓谕各番社，以狮头社番虐杀官兵之罪，毋惑，毋恐，毋助逆。洎驻营内外狮头番社，天讨于是大张。各番社震恐乞降，乃有率芒社、董的社、南片社、草山社、中心仑社、妈梨也社、阿栽米息社、大笼藕社、谢阿阁社、龟仔笼藕社、内龟纹社、外龟纹社、射不力社、中纹社、周武滥社诸番目陆续归命。唐定奎均给衣、履、酒食，命译宣示朝廷恩感，咸稽首愿受约束。于是设立招抚局，饬田勤生、孙继祖董之，示约七条：曰遵薙发，曰编户口，曰交凶逆，曰禁仇杀，曰立总目，曰垦番地，曰设番塾，以龟纹社番目为诸社头人，充总目统之。诸社违约，总目送官究治。三年无违，从优给赏。其狮头社余孽随在窜伏，即与擒献，如有漏网，亦不许复业，以昭炯戒。随更竹坑社曰永平，本武社曰永福，草山社曰永安，内外狮头社曰内外永化，各赦其胁从前罪，仍给屯垦。先择枋寮左右建义塾一区，令诸番社各送番童入塾，习语言文字以达其情，学拜跪礼让以柔其气。于是台南剿抚事定。沈葆桢奏陈始末，诏如所请，仍着保奖出力人员，以示鼓励。而淮军统将自王德成、张光亮病殁，其统营驻琅峤、枫港之李常孚、胡国恒亦相次病殁，员弁士卒报故者日相续不绝。田勤生以营务处兼统左军，于剿抚二事推为首功，又病殁于凤山。沈葆桢乃驰奏台南抚番就绪，淮军将士苦战之余，加以疫疾物故，抑已不少，深秋蒸郁，为日正长，大支劲旅，关国家元气，非及早量移，恐有不堪涉想者，应即陆续凯撤内渡，以苏士气。得旨报可。时沈葆桢已奉总督两江之命，福建陆路提督罗公亦以疫疾开缺，巡抚王凯泰奉旨渡台，办理善后事宜。六月，唐定奎檄饬营务处知县朱学沂率亲兵副营、武毅左军左营、右营、铭字中军左营为头队，统带铭字中军三营周志本率武毅左军正营、右军正营、左营、右营为次队，而唐定奎自督亲兵正营、后营暨局所文武员弁夫役为后队，各相次至旗后乘轮舟驶至扬州，分地驻营，以资休养。秋八月一日，唐定奎奉命补授直隶正定镇总兵。十五日，奉命升授福建陆路提督。其随营立功文武员弁，沈葆桢奏奉谕旨，各以次升赏有差。而故统带武毅左军提督张光亮、统带武毅右军提督王德成、统带武毅右军前营提督李常孚、管带武毅右军后营副将胡国恒、总理营务处兼带武毅左军知府田勤生及铭中副营哨官游击束维清，均奏奉谕旨，予谥建祠，生平事迹宣付史馆立传。其余在台阵亡病殁诸文武员弁一百有余，勇夫二千有余，亦奏奉谕旨，予赠荫恤赏，而建立淮军昭忠祠于凤山县，由地方官春秋致祭。唐定奎遂筹购田亩，以供岁修常祀，并护枋寮冢，凡万金有奇。岁属闽省安徽会馆稽察出入，以垂信守，请福建大府檄令施行。
是时，江南筹备海防，择江海要隘，建立炮台，而江阴南北两岸为由海入江门户，据地最重，役方未竣。会沈葆桢莅任江南，