鹤芝、林舞钥及勋臣之裔徐仁爵、李锡祚等，或有兵，或无兵，先后奔附。时唐王甫灭，所遗郡县，闻明兵至，多骚动。顺治四年，连陷建宁、邵武、兴化、福宁三府一州及漳浦、海澄、连江、长乐等二十七县。其陷兴化也，以分巡道彭遇颽故明御史，乘我守将出战时，登陴尽易明帜，我兵返，见之，遂溃。其陷建宁也，城中举火内应。其陷邵武也，明郧西王裨将王祈善战，先踞上游，夜取几案数百，各插香炷顺流放之，环邵武城而过，守兵矢炮齐发，迟明审其伪，习不复备。一夕突至，遂陷，进兵围福州。诏总督张存仁移驻衢州，诏都统辰奉为靖南大将军，与栋柯赖、李率泰等调广东、浙江之兵，三路进讨。又以陈锦代张存仁总督浙闽。会郑彩专横，贼杀朝士，其党内溃。王师且剿且抚，至顺治五年夏，各郡邑先后克复。福州岁饥，被围久，城中人相食。江西叛将金声桓之党郭天才伪称援兵，载米麦江上，诱郡民出就食。李率泰抵建宁闻之，飞檄巡抚佟国鼎使警备。贼乃夜焚洪山桥，掠就食千人以遁。延平有将军寨，地势巍峭，海寇巢其上，俯瞰诸邑。陈锦令于对山垒土，高与寨等，乘以登陴，遂克之。
是年，我松江提督吴兆胜谋叛，与明故官陈子龙潜招浙东海师内犯。张名振、沈廷扬赴之，遇飓崇明，尽丧其军。廷扬投海死。兆胜、子龙事泄被诛。名振遁还，乃与阮骏合军，以五年夏由南田陷健跳所，迎鲁王复入浙。时郑彩已弃王去。名振、阮骏合拒大兵，解健跳之围。九月，复合王朝先兵攻斩黄斌卿于舟山，奉鲁王居之，令阮骏、王朝先分屯桐樵、南田为犄角。而郑彩军金门，郑联军厦门，亦于七年尽为成功所夺。成功遣使朝永历于湖南，受封延平郡公。于是浙师尽并于张名振，闽师尽并于郑成功，东南海寇皆听其号令。
方四年闽地之失陷也，我大兵守浙者大半抽以赴闽。于是温、台、宁、绍诸遗民复乘间争结山寨，以数百计，而四明大兰山王翊之军、上虞东山李长祥之军、上虞平冈张煌言之军皆最坚整，并约舟山兵共窥宁、绍。会鄞县降官谢三宾来告变，我各城守将急捕内应，并调慈溪兵袭大兰，姚江兵捣东山，数路皆溃。届期舟山兵果入蛟门，抵之江口，观望而返。及五、六年闽地尽恢复，总督陈锦率大兵还浙东。七年，张名振忌杀王得先于舟山，得先部将来降，尽泄虚实。于是总督陈锦奏言：浙东舟山海寇及各山寨之寇皆以故国为名，狼狈相依；海寇登岸，则山寇为之接应；山寇被剿，则入海以避兵锋；交通闽、粤，窥伺苏、松，久为东南之患。臣广访进兵道路，由定关出海，距舟山百余里，乘风潮半日可到，攻其不备，决可克复。八年，诏锦与都统金砺、刘之源、提督田雄等会兵先剿山寨，以除内顾，用山民为乡导，分路进捣四明诸山，尽破巢穴。遂乘大雾渡海，抵螺头门，敌军方觉。阮骏以火舟邀战于横水洋，风返焚之，人舟俱熸。张肯堂、张名扬等率兵勇数千，背城力战。九月掘攻，陷之，屠其城。
初，名振恃海岛之险，谓大兵必不能渡，先期奉鲁王捣吴淞，以缀我兵，惟留兵六千，使阮骏守舟山。及闻警回救，则城已破，乃奉鲁王赴厦门，去监国号，为寓公。陈锦奏设陆兵千、水师二千于舟山。而成功在闽，复乘王师攻舟山之隙，大举寇沿海。
初，芝龙出入海中，每一商舶例入金三千，不得郑氏旗不能行也。及唐王时，又以练饷为名，闽、粤二省，正供外捐输百万，尽归郑氏，故富敌国，皆积安平镇。福建巡道黄澍、巡抚张学圣、总兵马得功、巡按王应元谋乘成功之出，捣安平巢穴，攫其赀。成功还，怒，以索偿为名，连陷同安、漳浦、南安、平和、海澄、长泰等县，进围漳州，七阅月。诏逮张学圣等入京治罪。九年三月，总督陈锦赴援，战于江东桥，不利，退屯同安。其奴刺之帐中，以首奔成功。成功赏而斩以徇。十月，都统金砺援军至，屡捷，成功退保海澄。我兵围之，城坏十余丈。成功亲当矢石，不退。一日，闻空炮递发，成功曰：『此号炮也，将薄城矣』！下令，兵皆挺巨斧以待。官兵四面蚁傅登城，城上众斧迎之，随斧随坠，濠为之平。我兵解围去。而张名振、张煌言亦屡以余军入长江，登金山燕子矶，遥祭孝陵，掠战艘三百于吴淞口。时成功始终为唐，二张始终为鲁，所奉不同，而其交甚睦。时明遗臣义旅渐亡，独两军犄角海上，而成功尤雄。
十年，朝廷下令招抚。芝龙、鸿逵皆封侯、伯，成功封海澄公。令芝龙少子世忠持芝龙书招之。芝豹、彩、联等皆降，独成功不受。张名振卒，以军付张煌言，亦屡拒李率泰、郎廷佐之招。是冬，成功乘机登岸措饷，大扰福州、兴化诸府。十一年，陷同安、南安等邑，复破舟山，据之。命郑亲王世子济度为定远大将军，赴闽防剿。以水师提督张天禄御寇海口，失战舰，匿不奏闻，褫职。十二年，成功进温、台，还攻宁德，杀守将，间遣使告捷于明桂王。十三年，将北犯，留其将黄梧守海澄。梧以成功用法严，曾以揭阳之败斩大将苏茂，遂惧而来降；诏封梧海澄公，守漳州。梧陈剿寇五策：一沿海以堵登岸，二造小舟以图中左，三清叛产以裕招徕，四锄奸商以绝接济，