小却；蓝翎都司陈康泰陷阵战殁。忽曾元福救兵到，苏、徐之兵回头力战。吕仔梓之妻素亲临阵鏖战，勇悍过男子；见阵势小挫，欲率亲兵略阵。忽一炮飞来，碎其头而死；贼大震。官兵乘势奋进，连战二昼夜，阵捉伪元帅叶新妇、伪大将军何钱鼠。严辨见势急，逃匿新港；吕仔梓投降，导引官兵攻破大仑庄。时吴帅诸部将惟苏吉良、徐荣生功绩最多，前后三百余战，生获贼酋二十余名。乃清庄通道，嘉义一带之路途始通行无阻。
吴帅惩林镇之败，欲先清道，搜剿余匪，然后出师；乃洪道轻信蜚语，迫令出军。吴往返辩论不已，洪道愈忌，竟责以「拥兵滞逗」之罪；谓二重溪吕仔梓一竹围之地，何以连攻两月之久尚不能下？吴帅接到公（？），即日班师而回。时曾元福扎白沙坑，军士多染时疫；忽接到督宪檄文令代统吴鸿源之众，乃纡海道至麦寮港登岸，接篆军事。
洪道自戴逆乱起，以知府坐升兵备道，即以平贼为己任；每日集群僚、绅士讨论剿贼之计，至深宵乃罢。时内地发逆未平，财政困难，巡抚徐宗干许洪就地筹饷；计捐有十余万元，不足需用。乃尽出其玩器、首饰珍品，售以赡军；再不足，权用钞票：牵萝补屋，日坐愁城。每论时政痛切，辄泣下沾襟。坐是抱疾不起，六月卒于任；弥留之际，手书示群僚，皆剿贼事宜。台郡进士施琼芳、福州赞善赵新，佥联名疏请「洪毓琛毁家纾难，保障全台；请于郡治建专祠，在官事迹宣示史馆」。巡抚徐宗干亦奏请从优议恤。后旨赠太常寺正卿，荫一子入监读书；并饬地方官将灵柩妥为照料，运回原籍安葬。
时贼渠杨目丁引贼党各处蹂躏乡村，凶无人理。陈捷三合义民数千扎沙仔仑，与贼大战。六月十六日，战于浊水溪，炮弹冲天。陈贞元引庄兵出助，未胜；幸水沙连陈上治引兵由南面包抄夹击，贼始不支。捷三乘胜冲锋，遇杨目丁于阵，举刀劈之，生擒以归；斩首摘心，以祭其兄。陈再裕斩贼首四十余级。余贼败归，犹蟠踞南投，攻打诸义庄；陈捷三与陈云龙率义兵数千人进剿，南投绅士吴联辉内应；南投收复，杀贼八十五人。捷三等遂进攻北投，林锡爵亦自北投助攻，吴联辉又引兵来会，军声大震；贼连日出战皆败，遂退屯施厝坪。其地与牛牯岭相去仅数里之远，陈捷三人地熟识，夜遣人放火攻之；贼骇溃，遂克施厝坪，与陈云龙分兵徇收附近乡村。七月二十二日，陈云龙攻克集集，斩贼百余级。时埔里社诸贼闻六堡之民树白旗，大骇；麇聚集集，图大举。陈云龙知之，与陈捷三率义民五千余人进攻之，咸死战不退；忽水沙连举人林凤池引兵来助，贼大败，退扎水社。
八月，群贼再围集集街，以图与斗六通消息。林、陈诸将各出兵与战，贼拚死而来，势颇锐；陈捷三之兄陈捷元（后任水师游击）引六堡之众来助。牛牯岭本高山，以高临下，势如骤雨。且捷元兄弟素得士心，器械精良、粮米充足，故守则无缺、战则有功；自军兴以来，大小数十战，少有败衄。是役杀贼三百六十余人，溪水尽赤。
九月，伪镇北大将军林大用诣曾玉明军营投降。因大用本居中寮，族大丁多，平昔与嘉宝潭陈耀有隙，常相攻杀；奈陈耀雄于财，恒为所侮。故红旗事起，转投贼，冀伸夙愤；诸贼甚重之，倚为北门筦钥。及是，陈耀已故，贼势又渐衰；知不能久持，始向曾军反正。群贼侦知，骇且愤，相率围攻之；大用逃匿于柑仔井。贼蹑至，大用与亲随二百人竭力拒战；曾军旋救至捒，贼方退。城中巨贼陈梓生、陈鮄、王万等知中寮归官，距城不满三里，知难久守；爰将酷敛财物潜运归四块厝，林晟亦潜守老巢，思所以抗拒官兵之计，只留江有仁、林猫等守彰城。江有仁于贼中亦狡黠异常，盖亦识朝不保暮；惟族微众寡，难逞其欲，故欲乘此机一伸其贪壑，然后别筹生路耳。
罗冠英、廖廷凤攻东大墩，守贼廖安然竭力死守；连日恶战，不克。张世英乃分兵进攻棋盘厝，适风大作，官兵纵火焚之；贼不支，败走。十九日，官兵乘胜攻破东大墩，通阿罩雾，廖安然犹作困兽之斗；忽后甲心中炮，遂死于阵中。附近之庄如石岗仔、枋寮、土牛，以次恢复。职员林文凤（字仪卿）、副将林文明率亲丁分头迎杀，新庄仔至鸟铳头、番仔寮等处之贼皆肃清。
冬十月，现任泉州陆路提督乌纳思齐巴图鲁林文察（字密卿）以家属在阿罩雾，桑梓之邦情形熟识，故闽浙总督左宗棠令带兵抵台助剿；武状元王世清为先锋，余部下属员皆东及猫罗堡之人为多，由帆船入麦寮港纡途回本居阿罩雾。新任兵备道丁曰健（字述安，安徽举人）带兵三千人抵竹堑，旋进驻牛骂头。先是，巡抚徐宗干檄催林占梅总办团练，占梅上书略陈台湾情形，且云『贼倚竹围为靠、于途为梗，所有大军皆由鹿港登岸；北路当有大员统驭，而后联络乡兵南下，则为功较易』。故徐中丞会左总督题奏，以丁曰健由北路顺捣，以主事周〔懋〕琦（字子玉，拔贡生）为参谋、副将关镇国为先锋，带兵三千人，会同林占梅克日进兵，由大甲抵牛骂头；令张世英、陈捷元、罗冠英由捒东攻林戆虎晟老巢，令王桢、郑荣辅之，攻其后路