七日，官银票局绅庄序端请给见银以利灌输；言『官局发用银票，通当见银二十五万数千两，军民信使；今□□至，台人知饟源已竭，西人银行及大小商民纷至索银，请发银收票，暂安众心』！永福无以应，仍令文案知县吴桐林内渡求接济（桐林遍走沿海各省，无应者）。当三发诸军之逼彰化，倭舰复来台南。二十二日，与我凤山海口炮台互击；船卒、台兵各有死伤，仍驶去。二十五日，精华、荣邦战连捷，精华获酋虏十三级、马三匹，解台南；荣邦电请饟械。二十九日，三发夺倭人大炮一、擒倭兵四、斩首数十级。八月初二日，精华、荣邦、义成仍电请饟械，语悲痛；永福括得银一千五百两济之，令姑给军食。初三日，商民持票索银愈急，卧守不去；局绅庄序端匿不敢出。于是楮贝填委，市易梗绝；军民饥困，日益不支。
方彰化之陷，生员徐骧率义民二十人逃后山，间道归台南；永福奖慰之，令往埤南番界募悍卒数千人助战。骧果集七百余人，皆壮健敢死，永福令为先锋营；是时驰抵前敌。初四日，与倭战，获小胜。而我屯彰化诸军饥困愈甚，三发与精华等议：『相持非久计，不如并力前进，夺回彰化，或可驻足』。初五日，遂合军进攻；而扼于城外炮台，不得进。初六日，荣邦先攻炮台；猛战，中炮死。初七日，义成亦攻炮台；受殊伤，诸军气益馁。十三日，倭兵大举来攻；三发率诸军力战，受创甚。徐骧、简精华率义民往援，斩十余级；倭始退。十四日，前敌诸军求饟益急，无策搜括；永福谓『内地诸公误我，我误台民』！旁皇莫能应。十九日，倭大队攻我，精华、义成御之，陷重围，及夜不得出；徐骧援之，三更始拔归营，而各负重伤。二十日复战，诸军大败，将士丧二千余人。二十二日，徐骧为军锋，奋战，诸军继之，倭颇却；骧旋中炮死，诸军夺气，大溃；云林、苗栗复陷。于时前敌诸军溃败相寻，而海口警报亦迭至。是月十一日，倭舰窥台南；永福自驻安平炮台，拒之。十七夜，倭舰分五路攻台南，炮声震郡城；永福历各台，督防守。十八日晓，倭船驶去，海岸解严。未几，前敌丧败，云林、苗栗相继陷。
二十三日，倭以炮队攻嘉义。王德标初营城外，倭至，走入城；倭踞营，夜半地雷发，轰毙倭七百人；倭惊退，德标设伏邀之，倭多死，大忿。二十四日，以车炮攻城，陷之；总兵柏正才、营官陈开檍、同知冯练芳、武举刘步升、生员杨文豹等皆死之，德标随精华奔后山。嘉义去府城百二十里；嘉义陷，而台南不可守。
先是七月初旬，日本台湾总督桦山资纪自英兵轮致永福书，说其率所部去台，谓将以礼送之内渡；永福复书却之，辞甚峻。八月，倭人渡兵澎湖；二十三日，其战舰、运船三十余艘载兵械，将以全力攻台南，直指安平海口。时陆路前敌诸军，已饥溃不支。嘉义将陷，英驻台领事欧思讷复为永福与倭约：和让台南，听永福内渡；已成言签名矣。会嘉义复陷，倭责永福徒手归命；永福怒，约乃绝。二十五日，倭舰攻旗后炮台；永福之子成良登炮拒守。奸民夜引倭由僻径登岸，突入大营，陷之。进陷炮台，台兵持两日，伤死枕藉，饥不能战；成良乘间冲出。二十六日，倭进凤山。义民拒战，大败；倭遂入凤山，屠戮甚惨，进犯台南府城。二十七日，台南戒严，永福移驻安平炮台。二十八日，各军饥哗，徐散去。二十九日，倭攻城外炮台，永福自发炮击之，毙倭数十人。九月一日，城中无食，饥军悉溃。初二日，永福驻炮台；城中土匪起，倭兵亦集，永福逃登德国「爹利士」商轮内渡（倭兵登船大索四次，不得）；从之者，其子成良与陈树南、柯壬贵诸部将及幕客数人。而溃军、台民数百万，胥委之去。台南亡。