究办；一面派员密访严烟下落、一面飞咨粤省躧缉洪二房及朱姓人踪迹，期于必获，以便归案办理』。谕军机大臣等：『常青办理此事，初时未免稍涉矜张；嗣据该督等节次奏到调度进剿各事宜，皆与朕意适合。不意常青竟能如此，甚属可嘉！至严烟籍隶漳州，不难实时擒获；并着常青于拏获该犯后，一并妥速解京。前因该处善后事宜紧要，恐常青究系初任，因思李侍尧外任有年、较为谙练，是以降旨调任，令其前往办理。此时该督惟应督率弁兵于应行办理之事悉心调度，以期迅速蒇事，朕必加恩嘉奖；更不必以调任萦心，稍存疑畏，转于剿捕无益。见在黄仕简、任承恩自必已到台湾；厚集兵势，合力剿捕，贼匪自无难立就歼灭。一得捷音，迅速驰奏』！
庚寅（二十一日），谕军机大臣等：『台湾地方自康熙年间始隶版图，因远隔海洋，该处府厅各县俱未建立城垣。后经朱一贵聚众滋事平定后，总督满保曾议建城；惟时以地处海外，无城虽难于防守，然失之易，复之亦易，是以未经建立以节繁费。但该处久成郡县，与内地无异；而城围尚相沿用竹木编插，不足以垂久远。且此次林爽文纠众猝起，县城遂被砍破，究由莿竹不能防御所致。朕意与其失之复取，既烦我兵力、骇众听闻，何如有城可守而勿失，更为有备无虞乎！况今国帑充盈，该处郡城、厅、县不过五处，即建立城垣，动用不过百万，何惜而不为！至建城时，如该处可立窑座，或用外博内土之法；如窑座不便，该处遍地皆山，即开采石料以代博土，更为巩固。着李侍尧于台匪荡平之后详细熟商，归入善后事宜案内一并妥议勘估，绘图具奏』。
二月乙已（初七日），常青奏：『十二月三十、正月初一等日贼攻郡城，镇、道督率弁兵义勇剿杀，毙贼甚多』。谕军机大臣等：『此次与贼打仗，文武官弁及兵民义勇人等协力剿杀，奋勇得胜，保护郡城，实属可嘉！俟常青抵台湾于剿捕完竣后，查明实在出力人员，分别奏请交部议叙。所有义民乡勇激发公义，协力剿贼，尤堪嘉奖；仅令地方官分别奖赏，尚不足以示鼓励。着常青于抵台湾后，查明各义民乡勇内如系务农经商生理者，即酌免交纳赋税；若系首先倡义绅衿本有顶带者，即开列名单，奏明酌予职衔，以示优异。至黄仕简、任承恩于正月初四、初六前后抵台，迄今已一月有余，何以尚未据奏报剿贼消息？该提督等系专阃大员，抵台湾已久，即待厚集兵力克期进攻，亦应将贼匪情形随时奏报；乃至今总无消息，所办何事？黄仕简、任承恩着传旨严行申饬。看来黄仕简、任承恩全不谙事理轻重缓急，且彼此俱系提督、不相统摄，竟有互相观望之意，于剿捕事宜不能得力。近来常青屡次奏报，甚有主见，筹办一切颇合机宜；此时李侍尧自已抵泉州，常青交印后，即速渡台湾，督同黄仕简等剿捕贼匪，务将贼首林爽文、王芬及此外有名头目擒拏解京，尽法惩团，不可任其逸入内山。原任山东按察使杨廷桦曾任台湾道，且在闽省年久，于该处情形自所熟习；其获咎因监犯越狱，究非私罪可比。前已有旨，交与李侍尧带往差遣委用；见值用人之际，即着杨廷桦补授台湾府知府，仍带革职留任。并传谕常青：俟李侍尧到后，即令杨廷桦渡台湾接印任事』。
己酉（十一日），谕军机大臣等：『前据常青奏：「鹿仔港署守备陈邦光带领弁兵率同泉州、粤省义民攻复彰化县城，擒获贼目高文麟等四犯」；又据徐嗣曾奏：「凤山滋事不法之贼首王启郎、曾锦等，已被拏获；贼人于十二月三十日来犯郡城，镇、道督义民与游击等分路剿杀贼匪无数」各等语。是彰化县城久经陈邦光等收复，其凤山等处亦经柴大纪等派兵分路剿捕，郡城已无事矣；何以黄仕简折内仅称「派委总兵等分赴南、北二路进剿，恢复县城」，竟似该处军情全未知悉者！看来黄仕简竟思安坐郡城，并不亲赴各该处督率剿捕，大属非是！提督为专阃大员，领兵是其专责。黄仕简深受朕恩，见带兵剿贼，虽系病后，理宜奋勉出力；乃于剿捕事宜奏报迟延，全不得行军要领，该提督所司何事？试思台湾郡城经贼人屡次攻犯，该镇等当大兵未到之先，尚能保护无虞；焉有此刻又添提督所带大兵，转须协同守御之理！岂黄仕简竟欲以守护郡城为名，迁延坐视耶？黄仕简，着传旨严行申饬。至任承恩由鹿仔港登岸，即应将该处贼匪情形及办理剿捕事宜先行具奏；乃日久并未据有奏报。见据常青折内称「该提督尚无进兵确信，探闻见在驻扎彰化」等语。任承恩系自请前赴台湾捕贼，既由鹿仔港一路进兵，即应督同陈邦光等上紧追捕杀贼，并知会黄仕简分路会合夹攻；何以驻守彰化漫无筹划，其心何居！任承恩，亦着传旨严行申饬』。
辛亥（十三日），谕：『台湾贼匪林爽文纠众滋事，见据任承恩奏：「台湾府知府孙景燧、彰化县知县俞峻、鹿仔港巡检冯敏宗同时被害；各将印信，令家属呈缴」等语。孙景燧等守御城池猝被戕害，殊堪怜悯！着交部从优议恤』。
壬子（十四日），免福建台湾府属本年额赋。
甲寅（十六日），谕军机大臣等：『任承恩既探知贼首林爽文潜回巢穴，自应多带弁