扰害建宁、邵武诸处，令臣速进兵剿灭。臣星夜至汀洲，整顿甲兵进剿』。上谕：『尚之孝速先平建宁诸处之贼，仍遵前旨率兵赴江西，与总督、巡抚、提督等共商剿抚江西余寇』。
庚戌（十九日），福建总督姚启圣奏：『臣以进攻厦门、金门等岛，酌拨兵一万四千名赴水师提督万正色军前。第沿海诸汛地兵力单弱，请召募新兵补额』。得旨：『进取厦门、金门诸处，事关重要。该督调拨兵丁，听万正色统领，克期破贼。其所请募兵补额，俟大将军康亲王题明满兵应撤、应留之处再议』。
甲寅（二十三日），昭武将军福建提督杨捷奏：『江西贼首伪都督吕贵等率贼三千余人犯崇汛，建宁城守游击李英破贼于岑阳山，悉歼其众』。下部议叙。
己未（二十八日），奉命大将军康亲王杰书奏：靖南王耿精忠、平南将军都统赖塔等遣兵败「海寇」于鳌头山。下部议叙。
十二月壬戌朔，先是，湖南总督蔡毓荣奏：『大兵进取辰龙关，必由枫水岭一路齐进；请专责一人总统之』。至是，议政王大臣等以蔡毓荣、周有德二人请旨简用；上命蔡毓荣为绥远将军，赐敕谕曰：『大兵进剿云、贵，各路绿旗官兵必须专责一人总辖调遣，始克允济。特授尔为绥远将军，总督常德、武冈等处所有各省调拨官兵；及湖广全省绿旗兵马，听尔酌量调度前进，底定疆圉。总督董卫国、周有德、提督桑峨、赵赖、周卜世俱听尔节制，商酌而行。一切平定云、贵及剿抚事宜，惟尔专责。至楚中见任文职官员。听尔遴选贤能，携赴军前调用。如有能备刍粮克济军机及官兵有能首先夺关、冒险直入击败贼众者，尔即开列劳绩具疏奏闻，论功加等议叙。如有临阵退缩、运粮违误者，副将、知府以下各官，即以军法从事；其以上各官，指名飞章参劾，从重治罪。水陆兵将不相习者，尔即具奏酌行更调。尔定期进取恢复地方，将破贼事宜密行知会广西等处王、将军、提督等齐乘机会而行；尔须严督兵将相机前进，力行剿除，毋得迟延，坐失时会。仍严加侦探，毋致疏虞。大兵一到，抗拒不顺者戮之；有先被贼胁从，实时迎降者，俱免诛戮。有能擒杀贼渠投诚者，分别升赏。须严禁兵将、申明纪律，经过地方毋得骚扰百姓，归顺良民加意抚恤。尔膺兹重任，宜掳忠竭力筹划周详；剿抚兼施，早奏肤功，以副朕简擢至意』。
丁卯（初六日），免福建海澄等十三县被兵逋赋。
己巳（初八日），福建水师提督万正色奏：『新船虽竣，旧船尚在督修；且檄调诸路兵及炮手，犹未悉至。臣即以新船配官兵先赴定海训练，俟舟师辏集，定期水陆夹攻』。上谕：『江南总督阿席熙速选善用炮者二千人送该提督军前，福建总督姚启圣等亦速遣士卒、修整舟舰。提督万正色其严饬将士，凡大兵所至，务当抚绥被寇之人，毋妄肆滛掠，负朕恤民至意』。
庚午（初九日），上召侍郎达都问曰：『尔自福建来，海寇形势如何？今岁有荡平之机否』？达都奏曰：『臣来时，厦门、金门贼势大挫，贼船较前甚少。闻海中粮米无从凑集，贼不能久待，不日可以底定』。上曰：『今海禁已严，贼粮何从而来』？达都奏曰：『贼所恃屯粮之处，俱为大兵所有；惟向广东高州海岛稍稍窃运而已』。上曰：『当贼匮粮之际，我大兵速取海澄要害之处，则贼失所凭依；全闽地方，可不久大定。若谓贼势较前已减，姑俟相机徐图，则贼何时可尽灭乎！夫师行既劳，民力重困；若能一举灭贼、地方速平，则大兵无野处之苦，民困亦自此苏矣』。
癸酉（十二日），福建水师提督万正色奏：『臣标前、后二营已设官兵，尚余新募水师万人；请增置援剿左、右、前、后四镇，各设总兵等官，即以投诚总兵林贤等补授』。下议政王大臣等集议行。
康熙十九年庚申（一六八○）春正月丙申（初六日），谕奉命大将军康亲王杰书：『王所奏据实指参事，已经览悉。朕思凡行一事，必前后计虑；果有裨于国家，始可举行。若轻率妄动，必致舛错。今广西、湖南、汉中、兴安等处俱已底定，逆贼余党引领以冀归正者。不止百千。若将耿精忠即行正法，不但已经投诚之人，以为后日亦必如此声明其罪；即未经投诚之人，睹此寒心，亦未可知：关系重要。前朕手谕欲令耿精忠来京者，盖撤回福建一半满兵之意；非欲即行处决，俾其先来也。如王善能劝谕令至京师，诸事皆得平安。王但加意开导之，不可轻举；彼如必不赴京，再行详悉密奏候旨』。
二月辛酉朔，谕议政王大臣等：『今成都、保宁皆已恢复，宜乘此机会速定云、贵。四川既平，湖广已属内地；其令顺承郡王勒尔锦、贝子准达、都统范达礼等尽率所部兵沂江而上，规取重庆；顺承郡王等即于重庆驻守，将军吴丹、鄂克济哈与赵良栋等同进取云、贵。吴丹、鄂克济哈于顺承郡王军中简精锐马兵，将之前行。总督杨茂勋、提督王之鼎驻守成都，王进宝驻守四川，徐治都还军守彝陵、荆州诸处』。
广西巡抚金俊奏：『海贼谢昌、李积凤等不时侵掠沿海地方，请调平南王藩下都