)  水月觀音贊(二十四首)  比丘觀音贊  蓮葉觀音贊(二首)  瑞蓮觀音贊  蓮花觀音贊(二首)  禪定觀音贊(三首)  白衣觀音贊(十首)  魚藍觀音贊(三首)  紫竹觀音贊(二首)  南海觀音贊(二首)  巖龕觀音贊(二首)  巖樹觀音贊  應變觀音贊  自在觀音贊(二首)  御刻觀音贊  普陀觀音贊(二首)
卷之三十四

  天衣觀音贊  草衣觀音贊  海潮觀音贊  海月觀音贊  空海觀音贊  將軍觀音贊  降魔觀音贊(二首)  圓通觀音贊  刺繡觀音贊(二首)  渡海觀音贊  大悲觀音贊(二首)  四臂觀音贊  禮佛觀音贊  火光觀音贊  寶掌菩薩贊  準提菩薩贊(三首)  日光菩薩贊  維摩大士贊  陳如尊者贊  三十三祖道景贊  十八尊者贊(三首)(已下古本卷二十)  園林遊戲圖合贊  十八尊者渡海贊  又贊(十五首)  又贊(十八首)  又贊(十八首)  金畫遊戲圖贊  十六應真圖贊  十四尊者贊  又十二尊者贊  十二尊者揭厲圖贊  補衲尊者贊(二首)  看經尊者贊(二首)  降龍尊者贊(二首)  伏虎尊者贊(二首)  調獅尊者贊  浮海尊者贊  渡江尊者贊(六首)  燒香尊者贊
卷之三十五

  達摩大師贊(十六首)  六祖大師贊  永明大師贊  諸祖道景略傳贊(四十八首)  金剛墖贊  三教圖贊  文昌帝君贊  老子贊(二首)  孔子贊  彭祖贊  呂純陽贊  漢壽亭侯贊  玉峰和尚贊  寶峰和尚贊  紫栢大師贊(五首)  雲棲大師贊(五首)  無明和尚贊  無邊和尚贊  空印大師贊(二首)  紹覺法師贊  靈徹法師贊  自光長老贊  大歇耆秊贊  定宗老宿贊  雪嶠山主贊  楚懷山主贊  衲雲師贊  虗谷公贊  月岸公贊  雪嶺公贊  澹居鎧公贊  自贊三十三首  胡中丞贊  王宗伯贊
卷之三十六

  佛祖機緣(三十則)(已下古本卷二十一)  金剛經頌(十八首)  十六玅觀  本住法頌


  座右箴  定志箴  我箴  身箴  心箴  性箴  命箴


  母子銘  澄心銘  觀心銘  師心銘  覺非銘  夢覺銘  忘緣銘  觀世銘  六根銘  念佛三昧銘  正心銘  誠意銘  修身銘  齊家銘  六玅銘  般若軒銘  毗耶室銘  鐵如意銘
卷之三十七
  偈一(七十二首)(已下古本卷二十二)

卷之三十八
  偈二(三百九首)

卷之三十九

  雜說(十九則)(已下古本卷二十三)  知止說  安貧說  學要說  牧心說  觀心說  讀莊子  圓扇說  寂寞說  誠心說(似曇支)  澤山說  覺夢說  醫說  此光樓說  無情佛性義說  四願齋說  感應說  張孝子甘露說  梁不遷字說  黃用中字說  歐嘉可字說  鄭士修字說  徐子厚字說  李容我字說  謝汝忠字說  方學之字說  僧洞聞字說  僧無隱字說  僧虗懷字說  聶應如字說  何希有字說  僧香林字說  僧堅白字說  自性說
卷之四十
疏文
  造文殊像疏(已下古本卷二十四)  小福園齋糧疏  旃檀佛疏  南花祖塔疏  曹溪祖庭疏  祖師景堂疏  花嚴接待疏  苦藤嶺茶菴疏  重修普濟寺疏  重建祇園寺疏  湖心亭佛墖疏  重修龍花寺疏  血書花嚴經願文  為靈通侍者(戒酒文見中興錄)  放生文  祭陸五臺太宰文  祭胡順菴中丞文  祭達觀大師文  祭雲棲大師文  祭續芳聯公文  祭[徹-育+鬲]空師文  結念佛社文  曾九龍對靈小參文  達大師舉火文
卷之四十一
  楞嚴懸鏡(卍已下四般。既[(冰-水+〡)*又]于釋教部。故不再出○古本卷二十五)

卷之四十二
  法花擊節(古本卷二十六)

卷之四十三
  楞嚴補注(古本卷二十七)

卷之四十四
  楞伽補遺(古本卷二十八)  大學決疑(古本卷二十九)

卷之四十五
  觀老莊景響論(已下古本卷三十)  道德經解發題  憨山緒言(已下古本卷三十一)

卷之四十六
  徑山雜說  化生儀軌(古本卷三十二)  淨土會語(闕)(古本卷三十三)  性相通說(上下闕)(古本卷三十四)

卷之四十(七八九)
  夢遊詩集上(古本卷三十五)  夢遊詩集下(古本卷三十六)

卷之五十
  曹溪中興錄(上)(已下古本卷三十七)  興復曹溪規約十條

卷之五十一
  曹溪中興錄(下)(已下古本卷三十八)

卷之五十二
  (為靈通侍者戒酒文)  (地脈緣起說