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大乐金刚不空真实三昧耶经般若波罗密多理趣释（二卷南竟北藁）
○般若波罗密多理趣经大安乐不空三昧真实金刚菩萨等一十七圣大曼荼罗义述（二纸半南竟北隶）
○瑜伽金刚顶经释字母品（二纸欠南取北止）
○仁王般若陀罗尼释（六纸余南学北杜）
○诸教决定名义论（三纸半南壁北古）
○圣佛母般若波罗密多九颂精义论（七纸半南壁北古）
佛母般若波罗密多圆集要义论（二纸半南书北星）
◎金刚顶瑜伽中发阿耨多罗三藐三菩提心论（六纸余南壁北通）
事师法五十颂（二纸余南优北言）
大智度论（一百卷南友投分切磨箴规仁慈隐 北傅训入奉母仪诸姑伯叔）
○金刚般若波罗密经论（三卷南次北受）
能断金刚般若波罗密多经论颂（七十七偈南次北颠）
○金刚般若波罗密经论（三卷南弗北受）
能断金刚般若波罗密多经论释（三卷南弗北亏）
金刚般若波罗密经破取著不坏假名论（二卷南离北弗）
○妙法莲华经优波提舍（二卷南离北亏）
○妙法莲华经论优波提舍（二卷南离北亏）
大般涅槃经论（九纸余南弗北颠）
涅槃经本有今无偈论（与上同卷南弗北颠）
○遗教经论（一卷南离北颠）
○二此土大乘释经论 （卷三十五）
大方广佛华严经疏（四十卷北作六十卷南颇至最北用至威）
华严经随疏演义钞（六十卷北作九十卷南精至丹北沙至禹）
○大方广佛华严经疏钞（三十卷） 稷税熟
○华严一乘教义分齐章（三卷北作四卷南丹北迹）
华严经指归（一卷南青北迹）
○华严经明法品内立三宝章（二卷南青北迹）
△大方广圆觉修多罗了义经略疏之钞（三十卷） 治本于
大方广圆觉修多罗了义经疏（四卷南石北缺）
佛说阿弥陀经疏（七纸南青北百）
◎佛说观无量寿佛经疏（一卷南法北约）
楞伽阿跋多罗宝经注解（四卷今作八卷北主南缺）
维摩诘所说经注（六卷北作十卷） 务
◎维摩诘所说经疏（十卷元朝藏中谦字号南北二藏并缺）
维摩诘所说经记（六卷元朝藏中谨字号南北二藏并缺）
◎四教义（六卷） 弊
金光明经玄义（二卷南遵北会）
金光明经文句（六卷南约北盟）
盂兰盆经疏（一卷南青北百）
首楞严经义海（三十卷南九州禹北翦颇牧）
大佛顶首楞严经会解（二十卷） 緜邈
请观音经疏（一卷南烦北法）
○金刚般若经疏（一卷南法北会卷三十六）
金刚经疏论纂要（三卷） 农
释金刚经刊定记（七卷） 农
金刚般若波罗密经注解（一卷南缺北主）
○仁王护国般若经疏（五卷） 韩
般若波罗密多心经略疏（九纸南青北百）
般若波罗密多心经集注（一卷南石北缺）
般若波罗密多心经注解（三纸南缺北主）
◎妙法莲华经玄义（二十卷南实宁北密勿）
◎妙法莲华经文句（二十卷南更霸北实宁）
◎观音玄义（二卷南何北遵）
◎观音义疏（二卷南何北遵）
妙法莲华经要解（二十卷） 旷远
◎大般涅槃经玄义（二卷南践北灭）
大般涅槃经疏（古十八卷南作二十六卷北作三十三卷南土会盟北灭虢践）
佛遗教经论疏节要（一卷南丹北迹）
○菩萨戒义疏（二卷南遵北何）
○二宗经论又二一西土二此土
○一西土大乘宗经论
○瑜伽师地论（百卷南节至静北犹至气卷三十七）
△菩萨地持经（八卷南登北安）
决定藏论（三卷南好北性）
王法正理论（一卷南心北退）
○显扬圣教论（二十卷南情逸北分切）
显扬圣教论颂（一卷南心北退）
○大乘阿毗达磨集论（七卷南心北退）
○大乘阿毗达磨杂集论（十六卷南动神北磨箴）
○辩中边论颂（五纸半南爵北静）
○辩中边论（三卷南爵北静）
中边分别论（二卷南移北情）
○摄大乘论本（三卷南移北情）
摄大乘论（二卷南物北隐）
摄大乘论（三卷南物北隐）
○楞伽经唯识论（十九纸南都北静）
大乘唯识论（十