此等证。无漏种子。法尔本有。不从熏生。有漏亦应法尔有种。由熏增长。不别熏生。如是建立。因果不乱。
初净月师等。唯立本有竟。
（丑）二难陀师等惟立新熏亦三。初释义。二引证。三会违。（寅）今初。
有义。种子皆熏故生。（但以）所熏能熏俱无始有。故（言）诸种子无始成就。种子既是习气异名。习气必由熏习而有。如麻香气。华熏故生。
（寅）二引证。
如契经说。诸有情心。染净诸法所熏习故。（乃有）无量种子之所积集。论说内种定有熏习。外种熏习或有或无。又名言等三种熏习。总摄一切有漏法种。彼三既由熏习而有。故有漏种必藉熏生。无漏种生亦由熏习。（故诸圣教）。说闻熏习。（谓）闻净法界等流正法而熏起故。是（即）出世心（之）种子性故。
三种熏习者。一名言习气。二我执习气。三有支习气。具如第八卷中广明。净法界等流正法者。谓诸佛菩萨。以根本智。证清净法界妙理。以后得智。随顺众生。流出语言文字。诠显净法界理。令诸众生。寻名取悟。此所流出正法。与净法界相应。故名等流。
（寅）三会违。
有情本来。种性差别。不由无漏种子有无。但依有障无障建立。如瑜伽说。于真如境。若有毕竟二障种者。立为不般涅槃法性。若有毕竟所知障种非烦恼者。一分立为声闻种性。一分立为独觉种性。若无毕竟二障种者。即立彼为如来种性。故知本来种性差别。（但）依（有）障（无障）建立。非（依本有）无漏种（子）。所说（地狱）成就（三）无漏种（之）言。（乃）依当（来有）可生（义）。非（谓）已有（其）体。
不般涅槃法性。即一阐提种性也。余可知。二难陀师等。唯立新熏竟。
（丑）三护法正义本新合论三。初正释。二斥前。三结成。（寅）今初。
有义。种子各有二类。一者本有。谓无始来异熟识中。法尔而有（四）生。（五）蕴。（十二）处。（十八）界。功能差别。世尊依此。说诸有情。无始时来。有种种界。如恶叉聚。法尔而有。余所引证。广说如初。此即名为本性住种。二者始起。谓无始来。数收现行熏习而有。世尊依此。说有情心。染净诸法。所熏习故。无量种子之所积集。诸论亦说染净种子。由染净法熏习故生。此即名为习所成种。
（寅）二斥前又二。初斥唯本有。二斥唯新熏。（卯）今初。
若唯本有。转识不应与阿赖耶为因缘性。如契经说。诸法于识藏。识于法亦尔。更互为果性。亦常为因性。
宗镜释云。诸法于识藏。能摄藏也。谓与诸法作二缘性。一为彼种子。二为彼所依。识于法亦尔。所摄藏也。谓诸转识。与阿赖耶亦为二缘。一于现法长养彼种。二于后法转摄植彼种。互相生故。
此颂意言阿赖耶识。与诸转识。于一切时。展转相生。互为因果。摄大乘说。阿赖耶识。与杂染法。互为因缘。如炷与焰。展转生烧。又如束芦。互相依住。唯依此（种现）二（法互相生义。）建立因缘。所余因缘。不可得故。若诸种子不由熏生。如何转识与阿赖耶有因缘义。非熏令长。（即便）可名因缘。勿善恶业（能招异熟。亦可）与异熟果为因缘故。又诸圣教。说有种子由熏习生。皆违彼义。故唯本有。理教相违。
熏长。但可名增上缘。熏生。乃名因缘也。余可知。
（卯）二斥唯新熏又三。初正破。二通教。三结责。（辰）初又二。初斥非。二显正。（巳）初又二。初直约有为无漏因破。二破转计心性为无漏因。（午）今初。
若唯始起。（则）有为无漏无（本有）因缘故。应不得生。（若夫闻熏乃）有漏（善）。不应为无漏种。勿无漏种。（亦可）生有漏故。许应诸佛有漏复生。善等应为不善等种。
有为无漏。指四智菩提也。四智菩提。理应先有本住种子。未登地前。所有闻。思。修慧。俱属有漏。但可为增上缘。助彼无漏种子令渐增长。非可作因缘也。设许有漏为无漏种。亦应无漏为有漏种。而诸佛已证无漏。仍得生有漏矣。岂理也哉。又有漏无漏。两性相反。设得互相为种。则善恶二性相反。亦得互相为种乎。
（午）二破转计心性为无漏因又三。初出彼所凭。二破彼谬解。三申经正义。（未）今初。
分别论者。虽作是说。（经云）。心性本净。客尘烦恼所染污故。名为杂染。离烦恼时。转成无漏。（以此为证）。故无漏法。非无因生。
（未）二破彼谬解。
而心性（之）言。（汝谓）彼（经）说何义（耶）。若（谓彼经）说空理（为本净者。）空非（四智）心因。（又空理是）常法。定非诸法种子。以（空理之）体。前后无转变故。若（谓彼经）即说心（为本净。