《佛印三昧经》一卷
《法华三昧经》一卷
《月灯三昧经》一卷
《定意三昧经》一卷
《般舟三昧念佛章经》一卷
《四百三昧名经》一卷（抄。）
《庾伽三磨斯经》一卷（译言《修行略》。一名《达磨多罗禅法》，或云《达磨多罗菩萨撰禅经要集》。）
《禅定方便次第法经》一卷
《禅定呵欲经》一卷
《禅秘要经》一卷（抄。《禅要秘密治病经》所出。）
《治禅鬼魅不安经》一卷（抄。《禅要秘密治病经》所出。）
《阿练若习禅法经》一卷（即是抄《菩萨禅法》第一卷。）
《禅法》一卷
《说数息事经》一卷
《恒河譬喻经》一卷（抄。）
《须河譬喻经》一卷
《须河譬经》一卷（与前《须河譬》大同小异。）
《灰河经》一卷
《尘土灰河譬喻经》一卷（与前《灰河》小异。）
《水喻经》一卷（抄《阿含》。）
《铸金喻经》一卷（抄。）
《浮木譬喻经》一卷
《田夫喻经》一卷（抄《阿含》。）
《婴儿譬喻经》一卷（抄《阿含》。）
《群牛譬经》一卷（抄《阿含》。）
《羊群喻经》一卷（抄。）
《大蛇譬喻经》一卷（《旧录》云，《大蛇经》。）
《飞鸟喻经》一卷（抄《阿含》。）
《憋喻经》一卷（抄《六度集》。）
《马喻经》一卷（抄。）
《箭喻经》一卷（抄《阿含》。）
《木杵喻经》一卷（抄《阿含》。）
《毒喻经》一卷（出《生经》。）
《毒草喻经》一卷（出《生经》。或云《毒草经》。）
《毒悔喻经》一卷（出《生经》。）
《调达喻经》一卷
《爪甲擎土譬经》一卷（《旧录》云，《爪甲取土经》。）
《譬喻六人经》一卷（抄《骂意经》。）
《譬喻经》一卷
《譬喻经》一卷（异出。）
《法句譬喻经》一卷（凡十七事。或云《法句譬经》。）
《杂譬喻经》一卷（凡十一事。）
安法师载《竺法护经目》有《譬喻经三百首》二十五卷，混无名目，难可分别。今新撰所得，并列名定卷，以晓览者。寻此众本，多出大经，虽时失译名，然护公所出或在其中矣。）
《梵音偈本》一卷
《陀罗尼偈》一卷（抄。）
《阿弥陀佛偈》一卷
《後出阿引人注目陀佛偈》一卷
《七佛各说偈》一卷
《赞七佛偈》一卷
《深自知身偈》一卷（《旧录》云，《自知偈》。）
《禅经偈》一卷（抄《禅经》中偈。）
《怛{和心}尼百句》一卷
《五言咏颂本起》一卷（百四十二首。）
《道行品诸经胡音解》一卷
《灌顶七万二千神王护比丘咒经》一卷
《灌顶十二万神王护比丘尼咒经》一卷
《灌顶三归五戒带佩护身咒经》一卷
《灌顶百结神王护身咒经》一卷
《灌顶宫宅神王守镇左右咒经》一卷
《灌顶冢墓因缘四方神咒经》一卷
《灌顶伏魔对印大神咒经》一卷
《灌顶摩尼罗大神咒经》一卷
《灌顶召五方龙王摄疫毒神咒经》一卷
《灌顶梵天神策经》一卷
《灌顶普广经》一卷（本名《普广菩萨经》，或名《灌顶随愿往生十方净土经》，凡十一经。）
从《七万二千神王咒至召五方龙王咒》凡九经，是旧集《灌顶》，总名《大灌顶经》。从《梵天神策》及《普广经》、《拔除过罪经》，凡三卷，是後人所集，足《大灌顶》为十二卷。其《拔除过罪经》一卷已摘入《疑经录》中，故不两载。
《摩诃般若波罗蜜神咒》一卷
《般若波罗